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3月份下半月circRNA研究报道汇总
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2018-04-02 | 766 次浏览 | 分享到:


        下旬circRNA相关文献数量共计20篇,涉及研究方向较丰富,机制方面研究主要还是环绕miRNA sponge展开,其中cancer reaserch杂志发布的circPRKCI促进肺腺癌发展的文章,思路清晰、实验详尽非常值得参考下面我们一起解读这篇文献

 

circPRKCI促进肺腺癌发生发展

论文题目The circular RNA circPRKCI promotes tumor growth in lung adenocarcinoma

杂志cancer research
影响因子8.55

通讯作者单位南京医科大学附属肿瘤医院

肺腺癌LAC是目前最常见的一种实体肿瘤,研究者在前期的研究中,通过circRNA芯片发现了107个差异表达的circRNAs通过整合TCGA肺腺癌的CNVs数据,联合分析发现一个circPRKCIcircRNA分子该分子起源于PRKCI基因的(染色体3q26.2区异常扩增),并通过后续生物素标记miRNA探针共沉淀实验发现circPRKCI可吸附miR-545miR-589后,上调E2F7进而促进肺腺癌的发展。

 

CircPRKCI促进肺腺癌发展的分子机制示意图

circPRKCI表达水平研究

 

: A,circRNA5对肺腺癌中的表达热图展示;B:circos图展示circRNA和宿主基因的表达模式内圈为circRNA外圈为宿主基因

 

图注C图联合TCGACNV数据筛选基因扩增或缺失区域的circRNAsDcircPRKCI来源于PRKCI15,16号外显子反向剪接示意图;ERTPCR检测circPRKCI

 

图注LAC肺腺癌细胞中RNase R处理后qPCR检测circRNA和宿主基因的表达水平circPRKCI耐受RNA酶消化。

 

图注circPRKCI48对肺腺癌患者组织标本中高表达,且与肿瘤级别正相关。

 

 

图注E图生存分析发现circPRKCI高表达的患者生存期更短Fcox多元回归分析发现circPRKCI表达是不良预后的独立预测因素

circPRKCI促进肺腺癌细胞恶性增殖

 

图注asiRNA干扰circPRKCI设计示意图bcqPCR检测siRNA干扰和过表达质粒处理后circPRKCI的表达水平def图克隆形成EdUCCK8实验表明circPRKCI促进SPC-A1细胞增殖;G图干扰circPRKCI后细胞周期阻滞在G1期;Htranswell实验表明circPRKCI促进肺腺癌癌细胞SPC-A1侵袭。

circPRKCI吸附miR-545miR-589上调E2F7表达

 

图注:ab图显示经FISH实验表明circPRKCI主要定位在细胞质c图用抗Ago2蛋白抗体RIP实验表明circPRKCIAgo2结合D图生物素标记 miR-545, miR-589, miR-600, miR-144 and miR-670免疫沉淀后检测circPRKCI的表达eAgo2 RIP实验表明Ago2蛋白可显著富集miR-545miR-589;FsiRNA干扰circPRKCI不影响miR-545, miR-589表达水平gmiR-545, miR-589不影响circPRKCI的表达HijkE2F7miR-545, miR-589的靶基因。

 

图注荧光素酶报告基因等实验进一步证明miR-545, miR-589调控E2F7。

circPRKCI通过结合miR-545, miR-589促进肺腺癌细胞增殖

 

图注:功能挽救实验证明circPRKCI通过miRNA发挥促癌功能。

 

五:体内动物实验证明circPRKCI促进LAC肿瘤形成

 

图注裸鼠肺腺癌皮下移植模型结果显示circPRKCI是潜在的治疗靶标

 

circRNA文献汇总表