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Cell Research:新型融合基因来源环形RNA可能作为肺癌诊断标志物
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2018-04-09 | 1578 次浏览 | 分享到:


48日,Cell Research杂志在线发表了四川大学华西医院Yong Peng为通讯作者的Letter文章,介绍发现来自融合基因EML4-ALK的环形RNA F-circEA有促进细胞增殖迁移的功能并且在融合基因EML4-ALK为阳性的NSCLC患者血清中能检测到F-circEA表明F-circEA有可能作为EML4-ALK阳性非小细胞肺癌的诊断标志物[1]


 

大家一定还记得2016Cell文章报道的白血病中融合基因来源的circRNA 具有促进癌症发生发展的重要发现[2]。融合基因来源的circRNA是高度疾病特异性的分子产物,是最理想的诊断标志物,因此具有非常高的应用价值。本文正是基于这一发现的启发,探索非小细胞肺癌中常见的融合基因EML4-ALK是否会产生circRNA分子。通过在EML4-ALK阳性的细胞株H2228中进行PCR分析明确了有circRNA的存在继而分析干扰或过表达F-circEA后对细胞增殖迁移克隆形成等功能的影响。由于融合基因作为诊断标志物的独特优势,作者进一步分析了临床上EML4-ALK阳性的患者血液中是否具有可检测的F-circEA结果表明F-circEA可特异性的在患者血浆中检测到但对应的EML4-ALK mRNA仅存在于细胞质中,不会游离出来。本文的故事非常简短,思路也不是特别奇特或新颖,但还是有一定的临床意义,这或许也是本文能够发表在Cell Research杂志的主要原因吧。本文的思路或许能为各位同仁提供参考。

 

如何发现并验证F-circEA 

作者针对EML4-ALK融合基因的融合位点前后分别设计多种引物组合,然后选择EML4-ALK阳性的细胞株H2228和阴性细胞H1299 RNase R消化条件下鉴定产物,并进一步测序验证,最终确证了F-circEA的存在还通过Northern杂交验证了内源性F-circEA的真实性。与此同时,作者还分析了F-circEA的亚细胞定位表明它主要定位于细胞质中

 

1 发现并验证F-circEA [1]

 

F-circEA在肿瘤中的功能怎样 

F-circEA的存在与肿瘤发生发展的关系怎样的于是作者分别通过干扰和过表达进行了分析干扰后H2228细胞的Transwell效率下降,而在EML4-ALK阴性的细胞中过表达F-circEA则促进迁移F-circEA对细胞增殖和克隆形成的影响不明显

 

2 F-circEA促进癌细胞迁移[1]

 

F-circEA在临床标本的表达情况怎样 

F-circEA具有促进癌细胞迁移能力的作用那么在临床标本中的表达情况怎样呢作者挑选了EML4-ALK阳性的患者标本,分别分析肿瘤组织和血液中F-circEA的表达情况结果表明F-circEA可以同时存在于血浆和肿瘤组织中而融合基因EML4-ALKmRNA则只存在于肿瘤组织中没有在血浆中检测到

 

3 F-circEA可存在血浆中(来自[1]

 

本文的故事非常简短但由于融合基因的特殊性是高度疾病特异性的产物。本文的数据也表明F-circEA能够游离于血液中这就为临床检验找到了简易廉价的诊断手段有重要的临床应用价值。本文的思路可供各位同仁参考。

 

参考文献:

1. Shuangyan Tan, Q.G., Wenchen Pu, Chenglin Guo, Yun Yang, Ke Wu, Yaxin Liu, Lunxu Liu, Yu-Quan Wei and Yong Peng, Circular RNA F-circEA produced from EML4-ALK fusion gene as a novel liquid biopsy biomarker for non-small cell lung cancer. Cell Research, 2018.

2. Guarnerio, J., et al., Oncogenic Role of Fusion-circRNAs Derived from Cancer-Associated Chromosomal Translocations. Cell, 2016. 166(4): p. 1055-1056.