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10月下半月circRNA研究报道汇总
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2018-10-31 | 234 次浏览 | 分享到:


欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献23篇,下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。

 

1、长链非编码RNA:LINC-PINT来源的circRNA编码多肽抑制胶质母细胞瘤中的癌基因转录延伸

论文标题:A peptide encoded by circular form of LINC-PINT suppresses oncogenic transcriptional elongation in glioblastoma

杂志:Nat Commun. 影响因子:12.353

通讯作者单位:中山大学附属第一医院

环状RNA种类功能都具有多样性,关于环状RNA直接翻译蛋白或多肽调控细胞功能已有多篇报道。本研究前期通过高通量转录组和翻译组测序分析发现长非编码RNA LINC-PINT的2号外显子可单独形成Circ-PINT的环状RNA,Circ-PINT包含一个完整的开放阅读框,可能编码多肽,进一步通过制备针对该多肽的特异性抗体并结合CRISPR/cas9基因敲除细胞株等实验,证实Circ-PINT可通过核糖体进入位点序列IRES翻译出87个氨基酸组成的全新多肽PINT87aa通过结合聚合酶相关因子复合物基因PAF1,抑制多种癌基因的转录延伸,进而抑制恶性胶质瘤的发生和进展,细胞功能实验表明PINT87aa通过结合聚合酶相关因子复合物基因PAF1,抑制多种癌基因的转录延伸,进而抑制恶性胶质瘤的发生和进展,体内动物实验,在小鼠脑部原位以及皮下成瘤实验中过表达PINT87aa蛋白的肿瘤细胞,成瘤能力大大减弱,动物生存期延长,而基因敲除低成瘤细胞中circ-PINT的编码区的部分序列后,动物的成瘤能力得到增强,证实环状RNA circ-PINT翻译的多肽具有抑制肿瘤的作用。该研究结果提示环状RNA编码的多肽产物可能在恶性肿瘤诊断、预后及靶向治疗方面具有重要的研究意义,该文详细解读见往期文章Nature Communications:长非编码RNA形成环状RNA翻译功能性多肽

图注:证实Circ-PINT翻译全新多肽PINT87aa的系列实验

 

 

 

 

2、环状RNA-circAGO2通过HuR阻止AGO2-miRNA复合物形成维持靶基因稳定性促进肿瘤进展

论文标题:Circular RNA circAGO2 drives cancer progression through facilitating HuR-repressed functions of AGO2-miRNA complexes

杂志:Cell Death Differ. 影响因子:8

通讯作者单位:华中科技大学同济医学院

Argonaute 2(AGO2)是microRNA(miRNA)诱导的沉默复合物的核心成分,在肿瘤发生和侵袭性中起着重要作用。然而,调节AGO2在癌症中功能的机制仍然难以捉摸。在该研究中,研究者鉴定了由AGO2基因产生的一个内含子来源的环状RNA(circAGO2)在AGO2-miRNA复合物和癌症进展中起新型调控功能。CircAGO2在胃癌,结肠癌,前列腺癌和神经母细胞瘤中上调,并且与患者预后不良有关。CircAGO2在体外和体内实验中可促进癌细胞的生长,侵袭和转移。机理研究表明,circAGO2与人类抗原R(HuR)蛋白直接相互作用,circAGO2促进HuR在靶基因3'UTR区的活化和富集,从而减少AGO2结合miRNA和抑制AGO2/miRNA介导的基因沉默。在胃癌细胞中稳定干扰circAGO2后可抑制肿瘤细胞增殖和侵袭能力,皮下成瘤实验也表明干扰circAGO2后AGS细胞成瘤减弱,尾静脉注射sh-circAGO2细胞后肿瘤迁移能力下降。进一步基于HuR与circAGO2相互作用的分子模拟,设计了可阻断该相互作用的小肽HIP-13,实验表明该多肽能有效竞争性结合内源circAGO2,阻碍其与HuR的结合并抑制肿瘤迁移作用。这些实验结果表明circAGO2通过直接结合HuR抑制AGO2-miRNA复合物形成进而驱动癌症进展,为circRNA功能机制研究提供了新视角。该文详细解读见往期文章:Cell Death & Differentiation连发两篇circRNA研究论文

图注:体内外实验证实circAGO2可促进胃癌细胞增殖和迁移

 

 

3、人造circRNA海绵样吸附miR-21抑制胃癌细胞增殖

论文标题:Synthetic Circular RNA Functions as a miR-21 Sponge to Suppress Gastric Carcinoma Cell Proliferation

杂志:Mol Ther Nucleic Acids. 影响因子:5.66

通讯作者单位:西安交通大学第一附属医院

含有miRNA结合位点的miR海绵样序列被认为是潜在的强有力的分子治疗策略。天然形成的环状RNA(circRNA)在癌细胞中显示出了有效的miR海绵起作用。因此该研究推测人造的circRNA样海绵可以实现针对特定miR缺失的治疗性功能。首先将含有miR-21结合位点的线性RNA分子在体外转录;经去磷酸化和磷酸化后,使用T4 RNA连接酶1将线性序列5'-3'末端连接实现环化。随后研究者使用RNase R和胎牛血清评估circRNA稳定性;使用荧光素酶报告基因,细胞增殖和细胞凋亡实验在三种胃癌细胞系中评估合成的circRNA海绵对miR-21活性的竞争性抑制能力;还通过Tandem Mass Tag(TMT)标记技术筛查了miR-21下游蛋白质的circRNA海绵效应,进一步通过Western blot实验验证。该研究结论表明,可以使用简单的酶促连接步骤合成对RNase R耐受的人工circRNA海绵。circRNA海绵可抑制癌细胞增殖并抑制miR-21对下游蛋白质靶标(包括癌症蛋白质DAXX)的活性。人造的circRNA海绵代表了一种简单,有效,方便的策略,用于在体外实现特定靶向miR缺失功能,在人类疾病治疗中具有潜在应用价值。

 

图注:体外人造circRNA sponges流程图

每个结合位点序列与miR-21种子区域完全互补配对,间隔的9-12位序列含有凸起以防止RNAi切割和降解。一个PCR循环促进合成以产生双链DNA PCR片段,然后将其克隆到TOPO PCR克隆载体中。T7 RNA聚合酶结合到位于PCR插入物5'的T7 RNA聚合酶结合位点处,产生大量上述miR海绵序列的线性RNA。小牛肠磷酸酶使RNA转录物的5'末端去磷酸化, T4多核苷酸激酶(在ATP存在下)产生适于连接的RNA分子。最后T4 RNA连接酶孵育将线性RNA环化,得到人造circRNA sponges。

 

 

 

文献列表

 

序号

主要内容

论文标题

杂志

IF

单位

1

长链非编码RNA-LINC-PINT来源的circRNA编码多肽抑制胶质母细胞瘤中的癌基因转录延伸

A peptide encoded by circular form of LINC-PINT suppresses oncogenic transcriptional elongation in glioblastoma

Nat Commun.

12.353

中山大学附属第一医院

2

环状RNA-circAGO2通过HuR阻止AGO2-miRNA复合物形成维持靶基因稳定性促进肿瘤进展

Circular RNA circAGO2 drives cancer progression through facilitating HuR-repressed functions of AGO2-miRNA complexes

Cell Death Differ.

8

华中科技大学同济医学院

3

环状RNA-ACR通过调节Pink1/FAM65B途径抑制自噬进而减轻心肌缺血/再灌注损伤

The circular RNA ACR attenuates myocardial ischemia/reperfusion injury by suppressing autophagy via modulation of the Pink1/ FAM65B pathway

Cell Death Differ.

8

青岛大学医学院

4

RNA多聚酶II转录的增强型TuD发夹状miRNA吸附分子与ciRS7吸附活性比较

Enhanced Tailored MicroRNA Sponge Activity of RNA Pol II-Transcribed TuD Hairpins Relative to Ectopically Expressed ciRS7-Derived circRNAs

Mol Ther Nucleic Acids.

5.66

丹麦奥胡斯大学

5

合成环状RNA作为miR-21海绵抑制胃癌细胞增殖

Synthetic Circular RNA Functions as a miR-21 Sponge to Suppress Gastric Carcinoma Cell Proliferation

Mol Ther Nucleic Acids.

5.66

西安交通大学第一附属医院

6

环状RNA-circGprc5a翻译多肽促进膀胱癌进展

Circgprc5a promoted bladder oncogenesis and metastasis through Gprc5a-targeting peptide

Mol Ther Nucleic Acids.

5.66

郑州大学第一附属医院

7

circRNA_104075通过调节HNF4a刺激YAP依赖性肿瘤发生,可作为肝细胞癌的诊断标志物

circRNA_104075 stimulates YAP-dependent tumorigenesis through the regulation of HNF4a and may serve as a diagnostic marker in hepatocellular carcinoma

Cell Death Differ.

5.638

上海同济大学第十人民医院

8

Nrf2敲除小鼠的黑质和纹状体中差异表达的环状RNA分析

The Differentially Expressed Circular RNAs in the Substantia Nigra and Corpus Striatum of Nrf2-Knockout Mice

Cell Physiol Biochem.

5.5

河北医科大学

9

环状RNA在口腔鳞状细胞癌中的表达

Circular RNA Expression in Oral Squamous Cell Carcinoma

Front Oncol.

4.416

北京大学深圳医院

10

在转移性口腔粘膜黑色素瘤中环状RNA的表达模式变化

Altered expression pattern of circular RNAs in metastatic oral mucosal melanoma

Am J Cancer Res

3.998

上海市第九人民医院

11

综述:环状RNA在心血管疾病中进展

Circular RNA in cardiovascular disease

J Cell Physiol.

3.923

加拿大西部大学

12

Circ-U2AF1通过海绵样吸附hsa-miR-7-5p去抑制神经肿瘤学腹侧抗原2促进人脑胶质瘤

Circ-U2AF1 promotes human glioma via derepressing neuro-oncological ventral antigen 2 by sponging hsa-miR-7-5p

J Cell Physiol.

3.923

南方医科大学珠江医院

13

Circ_0058063通过海绵吸附miR-145-5p调节CDK6以促进膀胱癌进展

Circ_0058063 regulates CDK6 to promote bladder cancer progression by sponging miR-145-5p

J Cell Physiol.

3.923

中国医科大学附属盛京医院

14

过表达circ_0067934作为癌基因通过miR-545/EIF3C轴促进宫颈癌进展

Overexpressed circ_0067934 acts as an oncogene to facilitate cervical cancer progression via the miR-545/EIF3C axis

J Cell Physiol.

3.923

哈尔滨医科大学附属第四医院

15

竞争性内源性环状RNA ADAMTS14通过调节钙调神经蛋白1的microRNA-572 /调节因子抑制肝细胞癌的进展

The competing endogenous circular RNA ADAMTS14 suppressed hepatocellular carcinoma progression through regulating microRNA-572/regulator of calcineurin 1.

J Cell Physiol.

3.923

南京市六合区中医院

16

综述:环状RNA作为治疗试剂和靶标

Circular RNAs as Therapeutic Agents and Targets

Front Physiol.

3.394

慕尼黑大学

17

用于鉴定结肠直肠癌中共表达RNA网络和特征的差异表达环状RNA的分析

Analysis of differentially expressed circular RNAs for the identification of a coexpression RNA network and signature in colorectal cancer

J Cell Biochem.

2.959

新乡医科大学

18

Hsa_circ_0008309是口腔鳞状细胞癌的潜在生物标志物

Hsa_circ_0008309 May Be a Potential Biomarker for Oral Squamous Cell Carcinoma

Dis Markers

2.949

北京大学深圳医院

19

CircRNA相关的ceRNA网络揭示了下咽癌中的ErbB和Hippo信号通路

CircRNA-associated ceRNA network reveals ErbB and Hippo signaling pathways in hypopharyngeal cancer

Int J Mol Med.

2.784

昆明医科大学附属第一医院

20

Circ-DLG1促进食管鳞状细胞癌的增殖

Circ-DLG1 promotes the proliferation of esophageal squamous cell carcinoma

Onco Targets Ther.

2.656

南京医科大学

21

CircRNA has_circ_0078710吸附microRNA-31参与肝细胞癌进展

CircRNA has_circ_0078710 acts as the sponge of microRNA-31 involved in hepatocellular carcinoma progression

Gene

2.498

中山大学附属第一医院

22

高通量测序揭示人类增生性瘢痕中差异表达的lncRNA和circRNA及其相关的功能网络

Highthroughput sequencing reveals differentially expressed lncRNAs and circRNAs, and their associated functional network, in human hypertrophic scars

Mol Med Rep.

1.922

南昌市妇幼保健院

23

产气荚膜梭菌C型诱导仔猪坏死性肠炎模型中脾脏环状RNA表达谱

Circular RNA expression profile of spleen in a Clostridium perfringens type C-induced piglet model of necrotizing enteritis

FEBS Open Bio.

1.782

兰州生产工程技术研究中心