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12月上旬circRNA研究报道汇总
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2018-12-18 | 710 次浏览 | 分享到:


 

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献33篇,下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。

 

 

1、一种新型FLI1基因外显子来源的环状RNA通过协调节TET1和DNMT1促进乳腺癌转移

文献标题:A novel FLI1 exonic circular RNA promotes metastasis in breast cancer by coordinately regulating TET1 and DNMT1.

期刊:Genome Biol  影响因子:13.214

通讯作者单位:吉林大学第一医院

Friend白血病病毒综合因子1(FLI1),一种ETS转录因子家族成员,在血液系统恶性肿瘤中起着致癌驱动因子的作用,并促进实体肿瘤中的肿瘤生长。然而,关于在肿瘤中激活这种原癌基因的机制知之甚少。我们的免疫组织化学染色结果显示FLI1在晚期和转移性乳腺癌中异常过表达。使用CRISPR Cas9引导的免疫沉淀实验测定,我们在FLI1启动子染色质复合物中鉴定到一种环状RNA,其由FLI1外显子4-2-3组成,称为FECR1 .FECR1的过表达增强MDA-MB231乳腺癌细胞的侵袭性。值得注意的是,FECR1利用正反馈机制通过在启动子的CpG岛中诱导DNA低甲基化来激活FLI1。FECR1以顺式结合FLI1启动子并募集TET1,TET1一种积极参与DNA去甲基化的脱甲基酶。FECR1还与DNMT1反式结合并下调DNMT1,DNMT1是维持DNA甲基化所必需的甲基转移酶。这些数据表明FECR1环状RNA通过协调DNA甲基化和去甲基化酶的调节作为上游调控子来控制乳腺癌肿瘤生长。因此,FLI1不仅通过经典的癌蛋白途径,而且通过使用由其外显子环状RNA介导的表观遗传机制来驱动肿瘤转移。

 

 

 

图注:环状RNA(FECR1)协同调控DNMT1和TET1促进乳腺癌进展。A:UCSC基因组浏览器上显示FECR1结合DNMT1启动子区;B:过表达FECR1可下调DNMT1的表达水平(qPCR结果);C:RIP实验结果表明FECR1可结合募集TET1酶;D:FLI1通过形成circRNA(FECR1)正反馈调节(募集TET1去甲基化并抑制DNMT1)FLI1的表达,促进乳腺癌转移的机制模式图。

 

 

 

2、综述:环状RNA作为癌症生物标志物和主调控因子研究进展

文献标题:CircRNAs and cancer: biomarkers and master regulators

期刊:Semin Cancer Biol 影响因子:10.198

通讯作者单位:西班牙巴斯克大学

环状RNA(circRNA)是一类新的RNA调控分子,尽管数量相对丰富,但最近才开始探索。有好几千种基因能够产生circRNA,但是除了极少数circRNA之外的其它circRNA的功能仍有待确定。这些高度保守的分子在生疾病包括癌症发挥着重要生物学作用。circRNA最常被探索的功能是作为基因表达的主要调节因子,比如circRNA发挥海绵样作用吸附miRNAs进而间接调控下游基因翻译CircRNA还被证明通过直接调控基因转录和通过干扰剪接机制起作用。尽管circRNA与其对应线性RNA转录物相比通常以低丰度表示,但它们通常以组织和发育阶段特异性方式表达。加上由于共价闭环结构对RNA酶活性的显著的抗性,circRNA作为癌症和其他疾病的新型生物标志物显示出巨大的前景。在这篇综述中,作者综合讨论circRNA成,功能以及与癌症的关联的研究进展,并探讨其在临床疾病研究中的潜在应用方向

 

图注:该篇综述较为系统地统计了各种癌症中circRNA标志物的研究进展信息,值得参考。

 

 

3、脂肪细胞分泌的外泌体环状RNA通过靶向去泛素相关的USP7促进肝癌的生长

文献标题:

Exosome circRNA secreted from adipocytes promotes the growth of hepatocellular carcinoma by targeting deubiquitination related USP7

期刊:Oncogene 影响因子:6.854

通讯作者单位:天津医科大学肿瘤研究所

肝细胞癌(HCC)是肝癌的主要形式,其发病率,预后不良。已知脂肪组织通过脂肪因子的分泌在能量储存和代谢调节中起作用。环状RNA(circRNA)是一种新型的RNA分子,最近被认为是肿瘤发展的关键因子,但尚未确定源自脂肪组织的外泌体circRNA的作用。这篇文献中研究者发现HCC中脂肪分泌的外泌体circRNA可调控基因去泛素化过程,从而促进HCC细胞生长观察到外泌体去泛素化circRNAcirc-DB)在具有较高体脂比的HCC患者中上调。此外,体外和体内研究表明exo-circ-DB通过抑制miR-34a和激活去泛素化相关的USP7促进HCC生长并减少DNA损伤。结果显示脂肪外泌体对HCC细胞的作用可以通过敲低circ-DB来逆转。这些结果表明,脂肪细胞分泌的外泌体circRNA通过抑制miR-34a和激活USP7 /细胞周期蛋白A2信号通路促进肿瘤生长并减少DNA损伤。

 

图注:A:电子显微镜观测人血浆中外泌体形态;B:WB实验鉴定分离自正常人和HCC患者血浆中外泌体标志物CD63,Alix和Tsg101;C:NAT分析外泌体粒径大小;D:HCC患者体脂率分析图(高体脂率21个,低体脂率19个);E:circRNA芯片分析HCC患者高/低体脂率中差异circRNA表达;

 

图注:F&G:USP7在HCC高体脂率患者中高表达(WB实验);H&I:生物信息学预测circ-DB和miR-34a以及USP7之间的结合位点示意图;J:外泌体circ-DB和USP7表达水平成正相关;

 

 

 

4、p53-RBM25介导circAMOTL1L发生失调通过

circAMOTL1L-miR-193a-5p-Pcdha通路促进前列腺癌转移

文献标题:

Dysregulation of p53-RBM25-mediated circAMOTL1L biogenesis contributes toprostate cancer progression through the circAMOTL1L-miR-193a-5p-Pcdha pathway

期刊:Oncogene 影响因子:6.854

通讯作者单位:河北医科大学第二医院

p53,circRNA和miRNA是激活癌症转移EMT过程中分子调节网络的重要组成部分。然而,在前列腺癌(PCa)中,尚未研究p53是否以及如何通过circRNA和miRNA调节EMT。这篇文献里研究者发现Amotl1基因形成的circRNA,称为circAMOTL1L,在人PCa中下调,并且敲低circAMOTL1L后可通过下调E-钙粘蛋白和上调波形蛋白促进PCa细胞迁移和侵袭,从而导致EMT和PCa进展。机理实验证明PCa细胞中circAMOTL1L可起海绵样作用吸附miR-193a-5p,减轻miR-193a-5pPcdha基因簇(钙粘蛋白超家族成员的子集)的抑制。因此,由circAMOTL1L下调介导的circAMOTL1L-miR-193a-5p-Pcdha8分子途径的失调有助于体内PCa细胞转移。此外,研究结果显示RBM25直接结合circAMOTL1L并诱导其形成,而p53通过直接激活RBM25基因的表达调节EMT。这些发现表明p53/RBM25介导的circAMOTL1L-miR-193a-5p-Pcdha调节轴与PCa癌症转移EMT过程密切相关,为侵袭性PCa提供了潜在的治疗策略该文献详细解读见本公众号往期文章:荐读 | p53通过circAMOTL1L影响EMT的进程

 

 

参考文献列表

 

序号

主要内容

论文标题

杂志

IF

单位

1

一种新型FLI1基因外显子来源的环状RNA通过协同调节TET1和DNMT1促进乳腺癌转移

A novel FLI1 exonic circular RNA promotes metastasis in breast cancer by coordinately regulating TET1 and DNMT1.

Genome Biol.

13.214

吉林大学第一医院

2

综述:环状RNA作为癌症的生物标志物和主调控因子研究进展

CircRNAs and cancer: biomarkers and master regulators

Semin Cancer Biol

10.198

西班牙巴斯克大学

3

脂肪细胞分泌的外泌体环状RNA通过靶向去泛素相关的USP7促进肝癌的生长

Exosome circRNA secreted from adipocytes promotes the growth of hepatocellularcarcinoma by targeting deubiquitination-related USP7

Oncogene

6.854

天津医科大学肿瘤研究所

4

p53-RBM25介导circAMOTL1L发生失调通过circAMOTL1L-miR-193a-5p-Pcdha通路促进前列腺癌转移

Dysregulation of p53-RBM25-mediated circAMOTL1L biogenesis contributes toprostate cancer progression through the circAMOTL1L-miR-193a-5p-Pcdha pathway

Oncogene

6.854

河北医科大学第二医院

5

circZMYM2与miR-335-5p内源性竞争调控胰腺癌中的JMJD2C。

circZMYM2 Competed Endogenously with miR-335-5p to Regulate JMJD2C in Pancreatic Cancer.

Cell Physiol Biochem

5.5

苏州大学第三附属医院

6

circ_0005230表达增加显示乳腺癌预后较低,并通过miR-618/CBX8信号通路调控细胞增殖和侵袭

Increased Expression of Circular RNA circ_0005230 Indicates Dismal Prognosis inBreast Cancer and Regulates Cell Proliferation and Invasion via miR-618/ CBX8Signal Pathway

Cell Physiol Biochem

5.5

哈尔滨医科大学附属第二医院

7

环状RNA表达谱鉴定circADAMTS13为miR-484海绵抑制肝癌细胞增殖

Circular RNA profiling identifies circADAMTS13 as a miR-484 sponge whichsuppresses cell proliferation in hepatocellular carcinoma.

Mol Oncol

5.264

福建医科大学第一附属医院

8

环状RNA的核输出主要由其长度决定

The nuclear export of circular RNAs is primarily defined by their length

RNA Biol

5.216

重庆大学生命科学学院

9

创伤性脑损伤后小鼠大脑皮层损伤部位周围环状RNA的显著变化研究

Significant changes in circular RNA in the mouse cerebral cortex around an injurysite after traumatic brain injury

Exp Neurol

4.483

重庆医科大学第一附属医院

10

新的环状RNA通过竞争内源性RNA网络中的串扰参与早期HIV感染发病机制

Crosstalk in competing endogenous RNA networks reveals new circular RNAs involvedin the pathogenesis of early HIV infection

J Transl Med

4.197

中国医科大学第一附属医院

11

三七皂苷治疗阿兹海默症小鼠模型中与阿兹海默症相关的环状RNA差异表达谱的鉴定

Identification of Differentially Expressed Profiles of Alzheimer's DiseaseAssociated Circular RNAs in a Panax Notoginseng Saponins-Treated Alzheimer'sDisease Mouse Model

Comput Struct Biotechnol J

4.148

徐州医科大学

12

hsa_circRNA_0006528作为一种竞争性内源性RNA,通过清除miR-7-5p并激活MAPK/ERK信号通路,促进人类乳腺癌的进展

hsa_circRNA_0006528 as a competing endogenous RNA promotes human breast cancerprogression by sponging miR-7-5p and activating the MAPK/ERK signalling pathway.

Mol Carcinog

3.851

江南大学附属医院

13

环状RNA参与衰老:circRNA一个具有巨大潜力的新兴参与者

Circular RNA involvement in aging: An emerging player with great potential.

Mech Ageing Dev

3.739

华中科技大学同济医学院

14

Circ-SFMBT2通过海绵作用miR-182-5p增强CREB1表达,促进胃癌细胞增殖

Circ-SFMBT2 promotes the proliferation of gastric cancer cells through spongingmiR-182-5p to enhance CREB1 expression

Cancer Manag Res.

3.702

南京医科大学第一医院

15

勘误表:环状RNA CDR1as/miR-7信号促进骨肉瘤肿瘤生长,具有潜在的治疗和诊断价值[勘误表]。

Erratum: CircRNA CDR1as/miR-7 signals promote tumor growth of osteosarcoma with apotential therapeutic and diagnostic value [Corrigendum].

Cancer Manag Res.

3.702

上海市浦东新区人民医院

16

Hsa_circRNA_33287通过miR-214-3p/Runx3促进上颌窦膜干细胞成骨分化

Hsa_circRNA_33287 promotes the osteogenic differentiation of maxillary sinusmembrane stem cells via miR-214-3p/Runx3.

Biomed Pharmacother.

3.457

中山大学第一附属医院

17

猪地方性腹泻病毒感染引起的肠上皮细胞环状RNA表达谱分析

Profile analysis of circRNAs induced by porcine endemic diarrhea virus infection in porcine intestinal epithelial cells

Virology

3.374

中国农业科学院兰州兽医研究所

18

TCDD治疗乳腺癌细胞中环状RNA BARD1 (Hsa_circ_0001098)过表达可通过miR-3942/BARD1轴促进细胞凋亡

Circlular RNA BARD1 (Hsa_circ_0001098) overexpression in breast cancer cells withTCDD treatment could promote cell apoptosis via miR-3942/BARD1 axis

Cell Cycle

3.304

中国医科大学附属盛京医院

19

CircPCNXL2海绵样吸附miR-153通过上调ZEB2促进肾癌细胞增殖和侵袭

CircPCNXL2 sponges miR-153 to promote the proliferation and invasion of renalcancer cells through upregulating ZEB2

Cell Cycle

3.304

河南科技大学第一附属医院

20

两个circRNA特征预测临床无功能垂体腺瘤中的肿瘤复发

A two-circRNA signature predicts tumour recurrence in clinical non functioning pituitary adenoma

Oncol Rep

2.976

北京神经外科研究所

21

胶质母细胞瘤中过表达的circ_0029426通过海绵作用miR-197预测胶质瘤不良预后并促进癌细胞进展

Overexpressed circ_0029426 in glioblastoma forecasts unfavorable prognosis andpromotes cell progression by sponging miR-197

J Cell Biochem

2.959

河南省人民医院

22

上调环状RNA circ_0000502可预测骨肉瘤预后不良,并通过海绵作用miR-1238促进细胞进展

Upregulation of circular RNA circ_0000502 predicts unfavorable prognosis inosteosarcoma and facilitates cell progression via sponging miR-1238

J Cell Biochem

2.959

黑龙江省医院

23

环状RNA hsa_circ_0076248通过海绵样作用miR-181a调控SIRT1表达,促进胶质瘤的肿瘤发生。

Circular RNA hsa_circ_0076248 promotes oncogenesis of glioma by sponging miR-181ato modulate SIRT1 expression.

J Cell Biochem

2.959

中山大学中山纪念医院神经外科

24

Has_circ_0055625通过海绵作用miR-106b-5p增加结肠癌细胞的生长。

Has_circ_0055625 from circRNA profile increases colon cancer cell growth bysponging miR-106b-5p.

J Cell Biochem

2.959

青岛大学附属医院普外科

25

玉米淀粉中环状RNA的全基因组鉴定及功能分析

Genome-wide identification and functional analysis of circRNAs in Zea mays

PLoS One

2.766

陕西师范大学

26

环状RNA circ_0034642通过miR-1205提高BATF3的表达促进胶质瘤细胞增殖和侵袭

Circular RNA circ_0034642 elevates BATF3 expression and promotes cell proliferation and invasion through miR-1205 in glioma

Biochem Biophys Res Commun.

2.559

河南省人民医院

27

环状RNA circMTO1通过海绵样吸附miR-221抑制膀胱癌转移并抑制上皮-间质转化

Circular RNA circMTO1 suppresses bladder cancer metastasis by sponging miR-221and inhibiting epithelial-to-mesenchymal transition

Biochem Biophys Res Commun.

2.559

中南大学湘雅第三医院

28

mir -146b调控的肝星状细胞环状RNA表达的高通量测序策略。

High-Throughput Sequencing Strategy for miR-146b-regulated circRNA Expression in Hepatic Stellate Cells.

Med Sci Monit

1.894

南昌大学第一附属医院

29

hsa_circ_0000285的下调可作为膀胱癌的预后生物标志物,并与顺铂耐药有关

Downregulation of hsa_circ_0000285 serves as a prognostic biomarker for bladdercancer and is involved in cisplatin resistance

Neoplasma

1.696

佳木斯大学基础医学院

30

Circ-ITCH通过Wnt/β-catenin途径调节三阴性乳腺癌进展

Circ-ITCH regulates triple-negative breast cancer progression through theWnt/β-catenin pathway

Neoplasma

1.696

西安培华学院临床医学系

31

持续性房颤的风湿性心脏病患者中环状RNA表达谱研究

Circular RNA expression profiles of persistent atrial fibrillation in patientswith rheumatic heart disease

Anatol J Cardiol

1.271

第四军医大学西京医院

32

环状RNA全基因组注释及其与CIRCexplorer分析流程中的反向剪接/剪接方法介绍

Genome-Wide Annotation of circRNAs and Their Alternative Back-Splicing/Splicingwith CIRCexplorer Pipeline

Methods Mol Biol

NA

上海中国科学院生物科学研究所

33

环状RNA在人胰岛中的细胞特异性表达

Cell Type-Selective Expression of Circular RNAs in Human Pancreatic Islets

Noncoding RNA

NA

哥本哈根大学