标题摘要内容

 技术前沿 

关于我们/About
2月下旬circRNA研究报道汇总
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2019-02-28 | 290 次浏览 | 分享到:


欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计24篇,下面我们一起回顾下过去一个月circRNA有哪些进展。

1、肝细胞癌EMT过程中YY1复合物通过与Quaking超增强子结合促进Quaking表达

文献标题:YY1 complex promotes Quaking expression via super-enhancer binding during EMT of hepatocellular carcinoma

期刊:Cancer Res.   影响因子9.13

通讯作者单位:南开大学

QKI可变剪切因子在EMT(上皮间质转化)中可调控circRNA的形成,但具体机制还不明确。HCC肝细胞癌中,高表达的QKI预示临床短生存期,高转移性。该研究发现YY1/p65/p300复合物可促进QKI基因的转录激活,YY1结合QKI基因的超级增强子上,p65结合QKI的启动子,p300起到位置YY1复合体与QKI的结合作用。体内体外实验共同表明,YY1/p65/p300复合物增强QKI的表达并促进circRNA的形成,最终导致HCC恶性程度的增加。进一步的研究表明金丝桃苷(又名槲皮素-3-O-β-D-吡喃半乳糖苷,属于黄酮醇苷类化合物)可靶向YY1/p65/p300复合物抑制QKI的表达,阻止HCC细胞的恶性转化。

 

图注:QKIEMT过程相关并促进circRNA形成。AQKI过表达的PLC-PRF-5细胞表达谱芯片分析发现,主要与VEGFNF-KB通路激活,细胞粘附和凋亡途径下调相关。B:过表达QKI后上调基因主要与细胞增殖、迁移和血管生成相关。c、d、e:肿瘤、QKI过表达和YY1过表达组中circRNA聚类分析发现大部分circRNAQKIYY1影响。F:受QKIYY1过表达影响而上调的circRNA交集图。GcircRNAmiRNAmRNAceRNA互作网络图。HqPCR验证的部分受QKIYY1影响的circRNAIQKI调控的circ0008150, circ0007821,  circ0029308可促进细胞侵袭能力增强。

 

2、环状RNA cTFRC充当MicroRNA-107的海绵以促进膀胱癌进展

文献标题:Circular RNA cTFRC acts as the sponge of MicroRNA-107 to promote bladder carcinoma progression

 

期刊:Mol Cancer.   影响因子:7.776

通讯作者单位:西南医科大学附属中医医院

该研究首先针对3对膀胱癌患者组织进行circRNA高通量筛选,发现circRNA-cTFRC在膀胱癌中显著上调,且与肿瘤恶性程度和生存率密切相关。体内外实验表明敲定circRNA-cTFRC可显著抑制膀胱癌增殖和侵袭。进一步在膀胱癌细胞和临床组织标本中circRNA-cTFRCmiR-107负相关,另外上调circRNA-cTFRC可促进宿主基因TFRC的表达导致BC细胞EMT转化。表明circRNA-cTFRC在膀胱癌中起重要调控功能是潜在的诊断和治疗标志物。

 

图注:cTFRC介导TGF-β诱导的EMT过程。A-BTGF-β或LiCL处理EJ细胞EMT过程中cTFRCTFRC均增加(qPCRWB)。C:cTFRC过表达的BC细胞可观察到EMT样细胞形态。DWB分析cTFRC过表达的BC细胞中TFRC的表达水平升高。E:干扰cTFRC后,TFRC下调,E-cadherin上调。F:干扰TFRC后,E-cadherin上调。

 

3、精神分裂症患者皮质灰质中环状RNA减少可能改变相关miRNA的功能

文献标题:Circular RNA biogenesis is decreased in postmortem cortical gray matter in schizophrenia and may alter the bioavailability of associated miRNA

期刊:Neuropsychopharmacology 影响因子:6.544

通讯作者单位:澳大利亚悉尼精神分裂症研究所

 

环状RNA(circRNA)分子在哺乳动物大脑中相对稳定并且特别丰富,因此可能参与神经发育和功能。之前研究报道circRNA分子涉及突触可塑性等多个生物学过程,因此作者推测circRNA可能在神经行为障碍中起作用。该研究中作者利用circRNA高通量测序技术分析了35个皮质灰质(BA46)精神分裂症(已死亡)和非精神病学对照组的患者的脑皮质中circRNA表达。尽管在背外侧前额叶皮层(DLPFC)中鉴定出超过90,000种circRNA物种,但与对照相比,该病症标本中的circRNA复杂性较低,可变剪接率更高且快速耗尽。这些快速耗尽的circRNA预测结合的miRNA,跟多数上调的miRNA重合,预示circRNA可能通过miRNA发挥重要生理功能,差异表达的circRNA宿主基因的基因富集分析发现与神经功能和神经障碍显著相关,该研究首次报道精神分裂症中circRNAs表达异常,并提示circRNA在精神疾病的病理生理学中发挥重要作用,甚至可以作为治疗靶标。

 

文献列表: