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4月下旬circRNA研究报道汇总
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2019-04-30 | 490 次浏览 | 分享到:


欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献19篇,下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。

 

1、 环状RNA特定结构和降解机制在先天免疫调控PKR活化中发挥重要作用

论文标题:Structure and Degradation of Circular RNAs Regulate PKR Activation in Innate Immunity

杂志:cell. 影响因子:31.398

通讯作者单位:中国科学院上海生命科学研究院 


该研究成果由上海中科院陈玲玲教授,杨力教授和上海交通大学医学院附属仁济医院沈南教授团队共同完成。相比与今年年初cell发表的两篇肿瘤学相关circRNA文献,该研究侧重在circRNA降解及调控先天免疫的重要作用机制研究,首次清晰阐明circRNA降解机制,意义重大。主要有以下几大亮点:

Ø 在病毒感染后,circRNA被活化的RNase L全面降解

Ø 许多circRNA倾向于形成16-26bp的双链体并且充当内源性PKR抑制剂

Ø RNase L介导的circRNA降解是PKR活化所必需的

Ø 在自身免疫性疾病系统性红斑狼疮SLE中发现circRNA减少和异常PKR活化,过表达circRNA降低SLE患者PBMC中PKR的活性,提示circRNA是SLE等自身免疫疾病的治疗靶点。

该文献的详细解读请点击历史文章:重磅! Cell杂志再发circRNA研究论文

 

2、 肝细胞癌中circMAT2B通过miR-338-3p/PKM2信号轴促进糖酵解与肿瘤恶变

论文标题:Circular RNA MAT2B promotes glycolysis and malignancy of hepatocellular carcinoma via the miR-338-3p/PKM2 axis under hypoxic stress

杂志:Hepatology 影响因子:14.079

通讯作者单位:南京医科大学

该研究成果由南京医科大学附属鼓楼医院姜润秋和东南大学医学院王学浩团队共同完成,阐明了环状RNA—circMAT2B通过miR-338-3p调控PKM2,促进肝细胞癌糖酵解效应和肿瘤恶变。环状RNA在肿瘤糖酵解过程的功能机制研究尚少,该研究首先通过生信手段挖掘GEO在线数据库中肝细胞癌HCC中特异高表达的circMAT2B分子,异常高表达的circMAT2B病人预后更差。进一步功能研究表明,circMAT2B的表达与HCC糖酵解代谢状态呈现正相关,机制上circMAT2B可海绵样竞争性吸附miR-338-3p,进而调控糖酵解关键的代谢酶PKM2(丙酮酸激酶M2),阐明了HCC中异常高表达的circMAT2B能够促进HCC糖酵解和恶变,在HCC肿瘤代谢过程中其重要调控作用,从肿瘤代谢角度提示circRNA可作为HCC治疗的分子靶标。

该文献的详细解读请点击历史文章:Hepatology | 肝细胞癌中circMAT2B促进糖酵解与肿瘤恶变

 

图注:RNA Pull-down和RIP等实验证明circMAT2B与miR-338-3p直接相互作用

 

3、 环状RNA circβ-catenin翻译产物通过激活Wnt途径促进肝癌细胞生长

论文标题:Translation of the circular RNA circβ-catenin promotes liver cancer cell growth through activation of the Wnt pathway

杂志:Genome Biol 影响因子:13.214

通讯作者单位:广州中医药大学

 

该文献主要针对β-连环蛋白起源的环状RNA——circβ-catenin在肝癌中的功能机制研究。首先研究者基于 Wnt/β-catenin 通路在肝癌侵袭转移中的重要作用,通过在线数据挖掘(基于circRNA的RNA-seq数据)Wnt/β-catenin 通路起源的circRNA,最后锁定circβ-catenin临床标本中验证出circβ-catenin在肝癌组织中异常高表达进一步进行肝癌细胞功能实验研究,发现体内体外敲低circβ-catenin可显著抑制癌细胞生长,且circβ-catenin可广泛影响Wnt信号通路的相关基因。另外发现,circβ-catenin可编码一种新的β-连环蛋白同种型370个氨基酸的新蛋白,该新型β-连环蛋白同种型蛋白可通过拮抗GSK3β诱导的β-连环蛋白磷酸化和降解来稳定全长β-连环蛋白circβ-catenin形成的新蛋白可保护β-连环蛋白免受GSK3β介导的降解,从而加强了Wnt /β-连环蛋白途径的活化研究成果从circRNA翻译角度说明了circRNA通过Wnt途径调节肝癌细胞生长的功能,为肝癌治疗提供新思路。

 

 

图注:生信预测、pulldown、蛋白质谱和IRES报告基因等实验证明circβ-catenin翻译新蛋白

 

 

 

参考文献列表