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circRNA研究汇总|20190603-20190609
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2019-06-10 | 145 次浏览 | 分享到:

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献20篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。

1、CircACC1调节细胞代谢应激下AMPK复合物的组装和活化

论文标题:CircACC1 Regulates Assembly and Activation of AMPK Complex under Metabolic Stress

杂志:Cell Metab影响因子:20.565

通讯作者:吴缅(中国科学技术大学和胡汪(安徽医科大学)

该研究由中国科学技术大学吴缅和胡汪教授为共同通讯作者完成,首次报道circACC1,一种源自人ACC1的环状RNA,在细胞代谢应激反应中起关键作用。在血清缺失条件下,转录因子c-Jun响应上调CircACC1c-Jun主要上调circACC1而非ACC1circACC1通过与AMPK调节β和γ亚基形成三元复合物而起到稳定和促进AMPK全酶的酶活性的作用。circACC1的细胞水平调节脂肪酸β-氧化和糖酵解,导致细胞脂质储存产生重要变化。在肿瘤异种移植模型中,circACC1的沉默或表达分别导致生长抑制和增强。此外,结肠直肠癌组织中AMPK活化的增加通常与circACC1表达升高有关。研究结论表明,癌细胞在代谢重编程期间利用circACC1激活AMPKAMPK在细胞代谢过程中起核心作用,在细胞能量代谢过程中相当于开关作用,平衡细胞合成和分解代谢,同时是肿瘤治疗最重要的潜在靶标可见该研究阐明circRNA通过AMPK调控细胞能量代谢的重要意义。

图注:血清饥饿条件下,c-Jun特异性上调CircACC1CircACC1通过结合AMPK的β1和γ1调节亚基,进而稳定并激活AMPK复合物,AMPK的激活促进细胞中的脂肪酸β氧化和糖酵解。

2、环状RNA circTRIM33-12作为MicroRNA-191的海绵抑制肝细胞癌进展。

论文标题:Circular RNA circTRIM33-12 acts as the sponge of MicroRNA-191 to suppress hepatocellular carcinoma progression.

杂志:Mol Cancer影响因子:7.776

通讯作者:Guo-Ming Shi, Ai-Wu KeJia Fan (复旦大学生物医学研究院)

该研究发现circTRIM33-12在HCC肝细胞癌)组织和细胞系中下调。HCC中circTRIM33-12的下调与恶性特征显著相关,并且作为手术后HCC患者的总体存活(OS)和无复发存活(RFS)的独立危险因素。CircTRIM33-12在HCC细胞中的表达降低增加肿瘤增殖,迁移,侵袭和免疫逃避。在机理上,研究表明circTRIM33-12通过海绵吸附miR-191上调TET1表达DNA双加氧酶,DNA去甲基化关键蛋白),导致HCC细胞中5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)水平显着降低。5hmC为DNA去甲基化调控过程中重要的DNA修饰,研究表明5hmC作为强组织特异性的表观遗传标志物,可能是用于肿瘤诊断的更敏感标志物。该研究发现circTRIM33-12调控5hmC降低,对circRNA参与DNA甲基化调控具有重要意义。

图注:在体外体内实验结果均表明circTRIM3312可抑制HCC细胞

 

3、哺乳动物散在重复序列(MIRs)介导环状RNA ciRS-7 / CDR1as的生物形成

论文标题:Biosynthesis of Circular RNA ciRS-7/CDR1as Is Mediated by Mammalian-Wide Interspersed Repeats (MIRs)

杂志:BioRxiv  影响因子:NA

通讯作者:Jørgen KjemsAkila Mayeda 日本藤田健康大学

研究最早和最多的circRNA之一是ciRS-7CDR1as),可调控miR-7,然而,ciRS-7生物形成机制仍然是一个谜。该研究中阐述ciRS-7的生物合成途径。通常circRNA的形成反向剪接事件通过灵长类动物特异性Alu元件的侧翼反向重复序列来促进。但ciRS-7基因缺乏这些元件,相反,我们在ciRS-7鉴定了一组属于哺乳动物范围的散在重复(MIR)家族的侧翼倒置元件。在HEK293细胞中报告基因实验测定证明ciRS-7形成需要这些反向MIR,并且CRISPR / Cas9介导的缺失证实了SH-SY5Y细胞中内源性MIR元件的必要性。生物信息学分析,研究者确定了几个通过实验证实的其他MIR依赖性circRNA。因此该研究表明MIR介导的RNA环化是哺乳动物circRNA生物合成的新原理。本文详细解读请见本公众号历史文章:BioRxivMIR元件介导circRNA生成

图注:人与小鼠CDR1as两侧存在反向MIR元件

 

参考文献列表

序号

主要内容

论文标题

杂志

IF

单位

1

CircACC1调节细胞代谢应激下AMPK复合物的组装和活化

CircACC1 Regulates Assembly and Activation of AMPK Complex under Metabolic Stress

Cell Metab

20.565

中国科学技术大学

2

环状RNA circTRIM33-12作为MicroRNA-191的海绵抑制肝细胞癌进展。

Circular RNA circTRIM33-12 acts as the sponge of MicroRNA-191 to suppress hepatocellular carcinoma progression.

Mol Cancer

7.776

复旦大学生物医学研究院

3

circRNA_0025202通过miR-182-5p/FOXO3a轴来调节乳腺癌他莫昔芬敏感性和肿瘤进展。

circRNA_0025202 Regulates Tamoxifen Sensitivity and Tumor Progression via Regulating the miR-182-5p/FOXO3a Axis in Breast Cancer.

Mol Ther

7.008

山东大学齐鲁医院

4

circRNA circPTPRA通过海绵吸附miR-96-5p抑制NSCLC细胞的上皮-间质转化和转移。

The circRNA circPTPRA suppresses epithelial-mesenchymal transitioning and metastasis of NSCLC cells by sponging miR-96-5p.

EBioMedicine

6.183

蚌埠医学院第一附属医院

5

慢性淋巴细胞白血病中circ_0132266下调并通过miR-337-3p / PML轴促进细胞存活。

Downregulation of circ_0132266 in chronic lymphocytic leukemia promoted cell viability through miR-337-3p/PML axis.

Aging (Albany NY)

5.179

南京医科大学附属第一医院

6

SplintQuant:一种精确定量环状RNA转录本丰度而无逆转录偏倚的方法。

SplintQuant: A method for accurately quantifying circular RNA transcript abundance without reverse transcription bias.

RNA

4.49

弗林德斯癌症治疗创新研究中心

7

CircRNA-100338及mTOR信号通路和肝细胞癌预后不良有关。

CircRNA-100338 Is Associated With mTOR Signaling Pathway and Poor Prognosis in Hepatocellular Carcinoma.

Front Oncol

4.416

复旦大学肝癌研究所

8

肝细胞癌临床样本中RNA网络构建的分析。

Analyses of a Panel of Transcripts Identified From a Small Sample Size and Construction of RNA Networks in Hepatocellular Carcinoma.

Front Genet

4.151

中国科学技术大学

9

环状RNA和RNase L在PKR激活和病毒感染中的作用。

Circular RNAs and RNase L in PKR activation and virus infection.

Cell Biosci

3.219

美国国家癌症研究所

10

综述:环状RNA在乳腺癌中的新兴作用。

The Emerging Role of Circular RNAs in Breast Cancer.

Biosci Rep

2.899

南京医科大学附属第一医院

11

circPVT1:具有重要临床意义的致癌非编码RNA。

Circular PVT1: an oncogenic non-coding RNA with emerging clinical importance.

J Clin Pathol

2.894

印度加尔各答总统大学

12

多发性硬化症中环状RNAs的新型调节机制。

Circular RNAs as a novel layer of regulatory mechanism in multiple sclerosis.

J Neuroimmunol

2.655

波兰奥尔什丁瓦尔米亚玛祖里大学

13

环状RNA circ_0020123作为miR-488-3p的ceRNA来调节ADAM9表达来促进非小细胞肺癌进展。

Circular RNA circ_0020123 promotes non-small cell lung cancer progression by acting as a ceRNA for miR-488-3p to regulate ADAM9 expression.

Biochem Biophys Res Commun

2.559

齐齐哈尔医科大学附属第二医院

14

环状RNA circKMT2E 在糖尿病性白内障晶状体中上调,并海绵吸附miR-204-5p。

Circular RNA circ KMT2E is up-regulated in diabetic cataract lenses and is associated with miR-204-5p sponge function.

Gene

2.498

山东第一医科大学

15

老化猪肝的综合转录分析。

Comprehensive transcriptional profiling of aging porcine liver.

PeerJ

2.118

四川农业大学生命科学学院

16

在牙源性分化期间人牙髓细胞中环状RNA的表达变化。

Altered expression of circular RNA in human dental pulp cells during odontogenic differentiation.

Mol Med Rep

1.922

中山大学附属口腔医院

17

ceRNA网络分析鉴定circRNA可作为膀胱癌的预后生物标志物。

Analysis of ceRNA network identifies prognostic circRNA biomarkers in bladder cancer.

Neoplasma

1.696

中南大学湘雅二医院

18

外泌体在肝细胞癌的发展中起重要作用。

Exosome plays an important role in the development of hepatocellular carcinoma.

Pathol Res Pract

1.466

武汉大学中南医院

19

基于RNA深度测序的人结直肠癌中环状RNA的表达谱。

Expression profiles of circular RNAs in human colorectal cancer based on RNA deep sequencing.

J Clin Lab Anal

1.303

宁波大学医学院附属医院

20

哺乳动物全散在重复序列(MIRs)介导环状RNA ciRS-7 / CDR1as的生物合成

Biosynthesis of Circular RNA ciRS-7/CDR1as Is Mediated by Mammalian-Wide Interspersed Repeats (MIRs)

BioRxiv

NA

日本藤田健康大学