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circRNA研究汇总 | 20190923-0929
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2019-09-30 | 126 次浏览 | 分享到:

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献17篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。

 

1、综述:心脏和心血管系统中的环状RNA。

论文标题:Circles in the heart and cardiovascular system.

杂       志:Cardiovasc Res

影响因子:7.014

通讯作者:Roger Sik-Yin Foo(新加坡国立大学心血管研究所)

 

该综述系统回顾了近年来circRNA在心脏和心血管系统中研究几十年来,心血管疾病(CVD)是世界范围内发病和死亡最大的疾病之一,是全球医疗保健支出的主要负担。 尽管经过多年努力的CVD研究已步入正轨,但CVD的诊断,管理和治疗仍然不足。 急需新颖的治疗和干预方法。 现在越来越多的报道提示许多circRNACVD发病机理中重要调节分子。作者列举了已发表的与CVD疾病相关的circRNA分子列表,很多研究虽然发现了大量疾病状态下失调的circRNA分子,但具体的circRNA致病机理还需澄清,目前大部分研究还是聚焦在circRNA识别miRNA海绵方向,但基于circRNA序列全局性的miRNA作用位点生信预测结果并没有提供强有力的证据。因此这可能并不是circRNA的主要作用方式。此外circRNARBP互作,直接翻译成多肽也是重要的研究方向。高通量测序实验结果表明只有30%circRNA在小鼠和大鼠中保守,10%circRNA在人、小鼠和大鼠心脏中保守。因此在动物模型中针对这些保守的circRNA研究有利于阐明人类心脏疾病的作用机理。作者还重点提及了circRNA的一个少研究未开发的方向,circRNA的二级结构,circRNA的折叠方式对其功能可能有较大影响。最近一些研究表明:使用RNase V1裂解RNA的碱基配对区域并结合高通量测序方法,确定单链RNA形成完全配对或非规范配对的区域RNA碱基配对基序(RNA motif,例如circRNARNA碱基配对基序可能指导理解RNARNARNA-蛋白质相互作用。circRNA的折叠对于其在细胞内源功能很重要,circRNA的错误折叠导致疾病的发生同时作者还指出,circRNA研究最有前途的前景之一是它作为CVD的循环生物标记。 迄今为止,大多数研究受限于样本量小,统计分析有限和缺乏独立的验证。 是否存在循环系统中的circRNA作为游离分子,与配体结合或包裹在细胞外囊泡中如外泌体,微泡和凋亡小体。还有很多其他有趣的领域值得去探索。


图注:CVD相关的circRNA

 

2、上调circRNA ARHGAP10通过调节miR-150-5p / GLUT-1轴可预测NSCLC的不良预后。

论文标题:Upregulated circRNA ARHGAP10 Predicts an Unfavorable Prognosis in NSCLC through Regulation of the miR-150-5p/GLUT-1 Axis.

杂       志:Mol Ther Nucleic Acids 影响因子:5.919

通讯作者: chen yang(复旦大学附属华山医院泌尿科),刘建军(上海交通大学医学院附属仁济医院核医学科),黄钢(上海健康医学院院长)

 

该研究主要阐释了circARHGAP10NSCLC非小细胞肺癌)进展中的作用,之前的研究已观察到circARHGAP10NSCLC组织和细胞系中均显著上调。荧光原位杂交(FISH结果也显示circARHGAP10高表达且与NSCLC患者的不良预后相关。体外和体内实验均发现circARHGAP10的下调通过降低GLUT1的表达来抑制糖代谢。沉默circARHGAP10还可以通过靶向miR-150-5p / GLUT1轴来抑制NSCLC细胞增殖和转移,并得到荧光素酶报告基因检测结果证实。在敲除circARHGAP10后,GLUT1的过表达或miR-150-5p下调恢复NSCLC细胞的增殖和转移。综上所述,这些发现表明circARHGAP10通过充当miR-150-5p海绵来促进GLUT1表达,进而抑制NSCLC进展。因此,circARHGAP10可能是NSCLC治疗的潜在靶标。


图注:NSCLC非小细胞肺癌中circRNA差异表达谱分析

 

3、mRNAmiRNAlncRNAcircRNA的串扰及其在肺纤维化中的调控模式。

论文标题:Crosstalk of mRNA, miRNA, lncRNA, and circRNA and Their Regulatory Pattern in Pulmonary Fibrosis.

杂       志:Mol Ther Nucleic Acids 影响因子:5.919

通讯作者:宋晓冬副教授和吕长俊教授 滨州医学院

 

非编码RNAncRNA),例如microRNAmiRNA),长链ncRNAlncRNA)和环RNAcircRNA),是具有重要生物学功能的调控因子。因此,了解它们的相互间的串扰和调控模式可以为疾病治疗提供重要线索。在这项研究中,研究者通过博莱霉素诱导的小鼠肺纤维化模型,利用高通量测序方法,获得了差异表达的RNA转录本。在肺纤维化中有差异表达的585mRNA236miRNA272lncRNA74circRNA随后验证了4miRNA10lncRNA2circRNA进一步分析它们在染色体上的位置,长度变异,相互作用和宿主基因。研究者选择lnc949circ949circ057来探索它们间的详细的串扰和调控模式,通过使用RNA-FISH,双荧光素酶报告基因测定,实时细胞分析和拯救实验,共定位分析RNA免疫沉淀这些方法进行研究结果显示,三种ncRNA主要定位在细胞质中,其调控模式集中于转录后。lnc949影响肺纤维化功能取决于其宿主基因FKBP5circ949circ057lnc865lnc556形成了一个调控网络,同时调节靶向STAT3磷酸化的miR-29b-2-5p。总的来说,不同的RNA可以相互串扰,以通过不同的调节方式调节肺纤维化。该研究为肺纤维化的治疗提示了新的方向


图注:博莱霉素诱导的小鼠肺纤维化模型中circRNA差异表达谱

 

参考文献列表