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circRNA研究汇总 | 20190930-1006
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2019-10-08 | 102 次浏览 | 分享到:

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献22篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。

 

1、人脑中环状RNA表达情况研究

标题:The Landscape of Circular RNA Expression in the Human Brain.

杂志:Biol Psychiatry  

影响因子:11.501

通讯作者:Irina Voineagu(澳大利亚新南威尔士大学)

 

在该研究中,研究者主要针对近200个健康对照和自闭症病例的人脑组织样本中circRNA进行表达谱研究。最终鉴定到几百种全新circRNAs,且发现这些circRNA不是随机表达,具有主要表达模式的亚型。CircRNA表达在个体间的变异性不如大脑皮层和小脑之间的变异性明显。最后,研究者鉴定了自闭症样本中上调的circRNA共表达模块,从而为观察到的自闭症大脑中转录组变化增加了另一层复杂性。该研究为circRNA在大脑中的研究提供了一个全面的数据目录,并提供了免费网页工具查询浏览这些circRNA表达数据,为circRNA在大脑中的进一步深入研究提供了重要参考资源。(资源网址http://www.voineagulab.unsw.edu.au/circ_rna)。


图注:ZENBU基因组浏览器展示该文献中的circRNA表达数据,circRNA以线条形式呈现,红色代表表达值高,蓝色代表表达值偏低。

 

2剪接因子衍生的环状RNA——circUHRF1通过反馈回路加速口腔鳞状细胞癌的发生

标题:Splicing factor derived circular RNA circUHRF1 accelerates oral squamous cell carcinoma tumorigenesis via feedback loop.

杂志:Cell Death And Differentiation

影响因子:8.086

通讯作者:武杰,Zihao Liu(天津医科大学口腔医学院)和王左敏(首都医科大学北京朝阳医院)

 

该研究主要在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中鉴定了新circRNA——circUHRF1(hsa_circ_0002185)的生物形成机制和致癌作用。研究结果表明circUHRF1在OSCC细胞和组织中明显上调,circUHRF1的高表达与OSCC患者的不良预后密切相关。体外体内功能研究结果显示circUHRF1促进OSCC增殖,迁移,侵袭和上皮间充质转化(EMT),促进肿瘤生长。分子机制研究结果表明circUHRF1充当miR-526b-5p的海绵,从而上调c-Myc。转录因子c-Myc可以促进TGF-β1和ESRP1的转录。此外,剪接因子ESRP1通过靶向circUHRF1侧翼内含子促进了circUHRF1的环化和形成circUHRF1/miR-526b-5p/c-Myc/TGF-β1/ESRP1形成了正反馈环路研究通过circUHRF1/miR-526b-5p/c-Myc/TGF-β1/ESRP1反馈环确定了circUHRF1在OSCC肿瘤发生和EMT中的致癌作用,从而阐明了circUHRF1对OSCC的致病机制,OSCC治疗提供了潜在的治疗靶标。该文献详细解读,推荐阅读历史文章:Cell Death & Differentiation | 口腔鳞状细胞癌中circUHRF1促癌机制


图注:circUHRF1/miR-526b-5p/c-Myc/TGF-β1/ESRP1形成的反馈环路示意图

 

3NUDT21调节肝细胞癌中circRNA环化和ceRNA串扰。

标题:NUDT21 regulates circRNA cyclization and ceRNA crosstalk in hepatocellular carcinom

杂志:Oncogene

影响因子:6.634

通讯作者:朱曲波(中南大学湘雅药学院

 

NUDT21是一个保守的剪接因子,参与调控mRNA前体的组装。NUDT21绑定在poly(A)上游有两个UGUA元件形成二聚体环,从而阻止了CPSF介导mRNA前体裂解。作为关键的3'-UTR长度调控因子,敲低NUDT21(KD)将导致poly(A)位置近端选择,从而减少了3'-

UTR长度。之前研究表明HCC(肝癌)中NUDT21低表达,低水平NUDT21患者的总生存期无病生存较短。NUDT21表达也与肝癌患者的不良临床预后相关,例如较大的肿瘤,晚期肿瘤淋巴结转移的较早阶段远处转移。普遍的假设认为NUDT21减少缩短了各种致癌基因的3'-UTR,帮助癌基因成功躲避miRNA介导的抑制作用。但是,Poly A测序和TCGA RNA-Seq数据分析结果显示肿瘤中大多数致癌基因3'-UTR的长度几乎没有发生变化。另一种机制假说认为,癌基因的3'-UTR缩短通过破坏ceRNA-crosstalk的方式反式抑制抑癌基因的表达 的可能性更大,这可能是NUDT21在癌细胞中起作用的主要方式。由于circRNA是重要的ceRNA,可与miRNA结合并影响靶mRNA的稳定性和翻译效率,本文作者假设NUDT21缺失,除了导致3'-UTR缩短,还可以减少circRNA生物形成,然后释放miRNA以抑制HCC中的肿瘤抑癌基因。通过一系列实验结果表明,NUDT21的高表达对circRNA的形成至关重要,UGUA序列元件则对circRNA环化非常关键。HCC中敲低NUDT21可破坏circRNA-miRNA-mRNA的ceRNA途径,circRNA环化受到阻止,miRNA被释放进而抑制一部分抑癌基因的表达,最终导致HCC细胞不受控增殖。


图注:HCC肝癌中,NUDT21敲低后circRNA形成受到抑制

 

 

参考文献列表