吉赛生物拥有高通量测序、生物信息学、分子生物学、细胞生物学等技术平台,专注于circRNA相关技术与产品的研发。随着circRNA研究越来越系统全面,吉赛生物根据不同的需求与角度,将circRNA研究分为八大模块。
1. circRNA表达分析板块
1.1 全转录组测序
组织或细胞中总RNA去除rRNA后进行高通量测序分析
1.2 circRNA测序
样品经过RNase R消化去除线性RNA后,进行高通量测序分析
1.3外泌体测序
外泌体样品全转录组测序服务
1.4 高通量数据分析
已完成的高通量测序或芯片数据,或在线高通量测序或芯片数据的表达分析,组织/疾病特异性表达信息挖掘。
1.5 circRNA的QPCR检测
特定circRNA分子的QPCR检测服务,包括QPCR引物设计,QPCR检测。
1.6 circRNA的鉴定
特定circRNA分子的全长鉴定,RNase R耐受性测试等。
2. circRNA功能分析板块
2.1 circRNA过表达
特定circRNA分子的过表达载体构建,可进行序列插入、缺失、点突变等。包含表达载体、慢病毒等。
2.2 circRNA干扰
设计与验证circRNA的siRNA,shRNA载体。
2.3 细胞功能研究
细胞增殖实验(CCK-8、MTT生长曲线分析、克隆形成);迁移侵袭能力测试(划痕实验、Transwell实验);细胞周期检测;细胞凋亡检测。
2.4 常规动物实验
过表达或干扰特定circRNA的肿瘤细胞系,裸鼠成瘤能力测试、瘤转移能力测试、耐药动物实验等。
2.5 定制型circRNA功能研究内容
细胞自噬功能模型、铁死亡检测、细胞焦亡检测等。
3. circRNA表观转录组板块
3.1 circRNA m6A修饰分析技术
meRIP-seq测序与分析
4. circRNA翻译-验证研究板块
4.1 circRNA中ORF预测分析与验证
circRNA中潜在的ORF、IRES元件序列分析;构建载体验证ORF的翻译情况。
4.2 翻译组学测序与分析
Ribosome Profiling分析(Ribo-seq),RNC-seq测。
5. circRNA相互作用组学研究板块
5.1 circRNA-miRNA互作体系
miRNA 结合预测分析:从circRNA预测miRNA,从miRNA预测circRNA,circRNA-miRNA互作网络分析。
circRNA-miRNA相互作用的验证:anti-AGO2 RIP检测,标签法circRNA pull-down检测,FISH共定位分析。
5.2 circRNA-蛋白互作体系
RBP结合预测分析,标签法 circRNA pull-down蛋白质谱检测或westernblot检测,PPI互作网络分析。
5.3 circRNA-lncRNA互作体系
标签法 circRNA pull-down测序分析或QPCR分析,FISH共定位分析。
6. 功能性circRNA筛选验证板块
6.1 高通量circRNA shRNA文库
SCL-1文库,筛选模型设计验证;高通量文库筛选功能分子;
其他通用型shRNA文库。
6.2 定制化高通量circRNA shRNA文库
文库分子确认,定制shRNA文库,筛选模型设计验证,高通量文库筛选功能分子。
7. circRNA定位分析板块
FISH定位分析,细胞组分分离后QPCR检测。
8. circRNA高级结构分析板块
在线工具预测circRNA的二级结构