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技术前沿
circRNA研究汇总 | 20210118-0124
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2021-01-25 | 485 次浏览 | 分享到:

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计33,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

 

1环状RNA circSDHC充当miR-127-3p的海绵,通过CDKN3/ E2F1轴促进肾细胞癌的增殖和转移

标题:Circular RNA circSDHC serves as a sponge for miR-127-3p to promote the proliferation and metastasis of renal cell carcinoma via the CDKN3/E2F1 axis

杂志:Mol Cancer. 影响因子:15.302

通讯作者:陈崴、罗俊航和Jiaxing Zhang中山大学附属第一医院

 

越来越多的证据表明,环状RNAcircRNA)在癌症的发生和发展中起着重要的调节作用。但是,circRNA在肾细胞癌(RCC)中的表达模式和生物学功能仍然难以捉摸。该研究应用生物信息学方法筛选在RCC中差异表达的circRNA。在线circRNAs微阵列数据集和研究者自己的患者队列的分析表明,circSDHChsa_circ_0015004)在RCC中具有潜在的致癌作用。随后,通过qPCR测量RCC组织和细胞系中的circSDHC表达,并评估circSDHC的预后价值。此外,进行了一系列功能性体外和体内实验,以评估circSDHCRCC增殖和转移的影响。 RNApulldown测定,荧光素酶报告基因和荧光原位杂交测定被用来确认circSDHCmiR-127-3p及其靶基因之间的相互作用。研究结果显示:临床上,circSDHC的高表达与RCC患者的TNM分期晚期和生存不良有关。此外,circSDHC在体内和体外均促进肿瘤细胞的增殖和侵袭。对circSDHCRCC中作用的潜在机制的分析表明,它与miR-127-3p竞争性结合并阻止其抑制下游基因CDKN3E2F1途径,从而导致RCC恶性进展。此外,敲circSDHC会导致CDKN3表达降低和E2F1途径抑制,这可以通过用miR-127-3p抑制剂来挽救。该研究数据首次表明circSDHC/ miR-127-3p/ CDKN3/ E2F1轴在RCC进展中起着至关重要的作用。因此,circSDHC有望成为RCC患者的新治疗靶点。

 

图注: RCCcircSDHC 的特征分析

2、优化的靶向RNACRISPR/ Cas13d技术在识别功能性circRNA方面优于shRNA

标题:Optimized RNA-targeting CRISPR/Cas13d technology outperforms shRNA in identifying functional circRNAs

杂志:Genome Biol.影响因子:10.806

通讯作者:John G. Clohessy Pier Paolo Pandolfi (美国 贝斯以色列女执事医疗中心)

 

短发夹RNAshRNA)通过靶向反向剪接连接(BSJ)位点来抑制circRNA的表达 但是,shRNA介导的circRNA敲低与相应的生物学效应之间经常存在差异,它们的稳健性遭到质疑。 研究者通过利用CRISPR/ Cas13d工具并优化针对circRNA BSJ位点的single-guide RNA的策略,显增强了circRNA沉默的特异性。 shRNACRISPR/ Cas13d文库并行筛选实验验证了这种特异性。 研究者使用针对> 2500例人类肝细胞癌相关circRNACRISPR/ Cas13d筛选文库,随后鉴定了索拉非尼耐药circRNA的子集。 因此,CRISPR/ Cas13d代表了功能性circRNA高通量研究的有效方法。

  

图注:CRISPR/ Cas13d技术靶向circRNA的优化

 

3、环状RNA:表达定位和治疗潜力

标题:Circular RNAs: Expression, Localization, and Therapeutic Potentials

杂志:Mol Ther.Review 影响因子:8.986

通讯作者:杨柏华教授(加拿大多伦多大学

环状RNA是从反向剪接过程中产生的具有独特环状结构的RNA。这些环状分子是40多年前发现的,但直到最近才引起科学兴趣。越来越多的研究发现,这些环状RNA可能不仅是剪接过程的副产物,而且不同的细胞事件具有重要的调控功能。目前,大多数环状RNA正在癌症领域进行研究,其中许多已被证实与肿瘤发生过程有关。然而,许多环状RNA与癌症以外的疾病的发展阶段有关。在这篇综述中,我们重点讨论环状RNA在非癌症疾病,尤其是心血管疾病中的作用。在总结了circRNA的生命周期之后,我们根据我们的经验提供了研究circRNA-蛋白质相互作用的信息,从而调节了蛋白质的转运。此外,我们概述了circRNA在心血管疾病以及其他非癌症领域中作为有效生物标志物,有效治疗靶标和潜在治疗方法的潜力。


文献列表:

序号

主要内容

论文标题

杂志

影响因子

单位

1

环状RNA circSDHC充当miR-127-3p的海绵,通过CDKN3/E2F1轴促进肾细胞癌的增殖和转移

Circular RNA circSDHC serves as a sponge for miR-127-3p to promote the proliferation and metastasis of renal cell carcinoma via the CDKN3/E2F1 axis

Mol Cancer.

15.302

中山大学附属第一医院等

2

优化的靶向RNA的CRISPR/Cas13d技术在识别功能性circRNA方面优于shRNA

Optimized RNA-targeting CRISPR/Cas13d technology outperforms shRNA in identifying functional circRNAs

Genome Biol.

10.806

贝斯以色列女执事医疗中心等

3

环状RNA:表达、定位和治疗潜力

Circular RNAs: Expression, Localization, and Therapeutic Potentials

Mol Ther.Review

8.986

加拿大多伦多大学等

4

胰腺癌中的环状RNA:诊断和治疗作用的新途径

Circular RNA in pancreatic cancer: a novel avenue for the roles of diagnosis and treatment

Theranostics.Review

8.579

复旦大学胰腺肿瘤研究所等

5

circRNA_010383充当miR-135a的海绵,其表达下调可促进糖尿病性肾病的肾纤维化

circRNA_010383 Acts as a Sponge for miR-135a, and Its Downregulated Expression Contributes to Renal Fibrosis in Diabetic Nephropathy

Diabetes.

7.72

南方医科大学珠江医院等

6

RNA结合蛋白SFPQ保留长内含子剪接并调节哺乳动物的circRNA生物发生

The RNA-binding protein SFPQ preserves long-intron splicing and regulates circRNA biogenesis in mammals

Elife.

7.08

丹麦奥胡斯大学等

7

环状RNA circRUNX1通过海绵吸附MiR-296-3p并调节DDHD2表达来促进甲状腺乳头状癌的发展和转移

Circular RNA circRUNX1 promotes papillary thyroid cancer progression and metastasis by sponging MiR-296-3p and regulating DDHD2 expression

Cell Death Dis.

6.304

浙江省邵逸夫医院等

8

Hsa_circ_0007456通过miR-6852-3p/ICAM-1轴调节自然杀伤细胞介导的对肝细胞癌的细胞毒性

Hsa_circ_0007456 regulates the natural killer cell-mediated cytotoxicity toward hepatocellular carcinoma via the miR-6852-3p/ICAM-1 axis

Cell Death Dis.

6.304

台州市中心医院等

9

基于NEase的扩增可检测miRNA,多种miRNA和circRNA

NEase-based amplification for detection of miRNA, multiple miRNAs and circRNA

Anal Chim Acta.

5.977

武汉大学等

10

Circ_SMAD4通过激活wnt/β-catenin途径促进胃癌发生

Circ_SMAD4 promotes gastric carcinogenesis by activating wnt/尾-catenin pathway

Cell Prolif.

5.753

桂林医学院附属医院等

11

FUS诱导的环状RNA ZNF609通过海绵化miR-142-3p促进肺癌的发生和发展

FUS-induced circular RNA ZNF609 promotes tumorigenesis and progression via sponging miR-142-3p in lung cancer

J Cell Physiol.

5.546

郑州大学第一附属医院等

12

循环长和环状非编码RNA作为肝细胞癌的非侵入性诊断工具

Circulating Long and Circular Noncoding RNA as Non-Invasive Diagnostic Tools of Hepatocellular Carcinoma

Biomedicines.Review

4.717

意大利 里雅斯特大学等

13

CircCAMSAP1通过miR-1294/GRAMD1A途径促进肝癌进展

CircCAMSAP1 promotes hepatocellular carcinoma progression through miR-1294/GRAMD1A pathway

J Cell Mol Med.

4.486

右江民族医学院附属医院等

14

人扩张型心肌病中环状RNA表达的变化和ceRNA网络的构建

Analysis of changes in circular RNA expression and construction of ceRNA networks in human dilated cardiomyopathy

J Cell Mol Med.

4.486

复旦大学附属中山医院等

15

环状RNA circMYL1通过海绵吸附miR-2400并促进成肌细胞分化抑制增殖

Circular RNA circMYL1 Inhibit Proliferation and Promote Differentiation of Myoblasts by Sponging miR-2400

Cells.

4.366

西北农林科技大学等

16

肝细胞癌患者组织和血浆中三种新型circRNA上调及其调控网络

Three novel circRNAs upregulated in tissue and plasma from hepatocellular carcinoma patients and their regulatory network

Cancer Cell Int.

4.175

石河子大学医学院等

17

系统比对和分析比目鱼圆核RNA对鳗弧菌感染的反应。

Systematic Identification and Analysis of Circular RNAs of Japanese Flounder (Paralichthys olivaceus) in Response to Vibrio anguillarum Infection

Genes (Basel).

3.759

青岛海洋科学与技术国家实验室等

18

外周血hsa-circRNA5333-4:重症肌无力的新型生物标志物

Peripheral blood hsa-circRNA5333-4: A novel biomarker for myasthenia gravis

Clin Immunol.

3.368

郑州大学华大基因学院等

19

识别竞争性内源性RNA网络在黑素细胞氧化应激损伤中的作用。

Identification the Competing Endogenous RNA Networks in Oxidative Stress Injury of Melanocytes

DNA Cell Biol.

3.191

中南大学湘雅三医院等

20

Hsa_circ_0001073靶向miR-626/LIFR轴以抑制肺癌进展

Hsa_circ_0001073 targets miR-626/LIFR axis to inhibit lung cancer progression

Environ Toxicol.

3.118

淮安市第二人民医院等

21

非编码RNA和N6-甲基腺苷对癌症的影响:过去,现在和未来

The Impacts of Non-coding RNAs and N6-Methyladenosine on Cancer: Past, Present, and Future

Curr Cancer Drug Targets.

2.912

哈尔滨医科大学等

22

Circ_LDLR抑制基因通过调节miR-7/RNF38轴抑制肝细胞癌的进展

Circ_LDLR Knockdown Suppresses Progression of Hepatocellular Carcinoma via Modulating miR-7/RNF38 Axis

Cancer Manag Res.

2.886

河北医科大学第四医院等

23

circEIF6的上调通过靶向miR-557/SLC7A11/PI3K/AKT信号传导促进胰腺癌的发展

Up-Regulation of circEIF6 Contributes to Pancreatic Cancer Development Through Targeting miR-557/SLC7A11/PI3K/AKT Signaling

Cancer Manag Res.

2.886

荆州市第一人民医院等

24

环状RNA circNINL通过激活miR-921/ADAM9轴的β-catenin信号传导促进乳腺癌的进展

Circular RNA circNINL promotes breast cancer progression through activating 尾-catenin signaling via miR-921/ADAM9 axis

J Biochem.

2.476

青岛黄岛区人民医院等

25

环状RNA hsa_circ_0000554通过的miR-485-5p/fermitin family members 1轴促进食管癌进展并提高放射抵抗力

Circular RNA hsa_circ_0000554 promotes progression and elevates radioresistance through the miR-485-5p/fermitin family members 1 axis in esophageal cancer

Anticancer Drugs.

2.26

台州市中心医院等

26

环状RNA circ_0001287通过掺入microRNA miR-21并上调磷酸酶和张力蛋白同源物表达来抑制非小细胞肺癌细胞的增殖,转移和放射敏感性

Circular RNA circ_0001287 inhibits the proliferation, metastasis, and radiosensitivity of non-small cell lung cancer cells by sponging microRNA miR-21 and up-regulating phosphatase and tensin homolog expression

Bioengineered.

2.205

临沂市肿瘤医院等

27

circRNA/miRNA/mRNA调控网络的综合分析揭示了家蚕脂肪体内circRNA的潜在免疫功能

Integrative analysis of circRNA/miRNA/mRNA regulatory network reveals the potential immune function of circRNAs in the Bombyx mori fat body

J Invertebr Pathol.

2.074

江苏科技大学生物技术学院等

28

环状RNA circ_0008274通过海绵化miR-154-3p调节溶质载体家族7成员11增强甲状腺乳头状癌的恶性进展

Circular RNA circ_0008274 enhances the malignant progression of papillary thyroid carcinoma via modulating solute carrier family 7 member 11 by sponging miR-154-3p

Endocr J.

1.952

淮安市第一人民医院等

29

circRNA_102911/miR-129-5p/SOX6轴参与老年腹腔镜左肝切除术治疗肝结石的患者的T淋巴细胞免疫功能

The circRNA_102911/miR-129-5p/SOX6 axis is involved with T lymphocyte immune function in elderly patients with laparoscopic left hepatectomy for hepatolithiasis

Exp Ther Med.

1.785

北京301医院等

30

沉默环形RNA PUM1可通过miR-340-5p/FABP7轴抑制透明细胞肾细胞癌的进展

Silencing of circular RNA PUM1 inhibits clear cell renal cell carcinoma progression through the miR-340-5p/FABP7 axis

J Recept Signal Transduct Res.

1.466

海南医学院第一附属医院等

31

敲除circPUM1可以充当miR-21-5p的海绵,通过增强MAPK1表达来阻止甲状腺乳头状癌的细胞生长,转移和糖酵解

Knockdown of circPUM1 impedes cell growth, metastasis and glycolysis of papillary thyroid cancer via enhancing MAPK1 expression by serving as the sponge of miR-21-5p

Genes Genomics.

1.188

长治医学院附属和平医院等

32

circRNA_0005529通过调节miR-527/Sp1轴促进胃癌的生长和转移

circRNA_0005529 facilitates growth and metastasis of gastric cancer via regulating miR-527/Sp1 axis

BMC Mol Cell Biol

0

淮安市第二人民医院等

33

环状RNA:作为乳腺癌治疗靶标和生物标志物的潜在应用

Circular RNAs: Potential Applications as Therapeutic Targets and Biomarkers in Breast Cancer

Noncoding RNA

0

奥塔哥生物化学系等