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技术前沿
circRNA研究汇总 | 20210125-0131
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2021-02-01 | 402 次浏览 | 分享到:

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计37,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]


1、开发用于分析circRNA-microRNA互作的二合一集成测定法

标题:Development of a two-in-one integrated assay for the analysis of circRNA-microRNA interactions

杂志:Biosens Bioelectron. 影响因子:10.257

通讯作者:王忠云(南京医科大学第一附属医院)、高涛副教授(南京师范大学)、Yang Xiang(南京大学医药生物技术国家重点实验室)

 

竞争性内源RNA假说是RNA对话的新机制,其中circRNA-miRNA相互作用(cmRRI)被发现广泛参与肿瘤和其他疾病的基因表达调控。开发一种方便有效的方法来研究目标circRNA与候选miRNA之间的相互作用迫在眉睫,但具有挑战性。在这项工作中,研究者开发出一种可直接分析cmRRI的生物传感方法,以揭示RNA互作机制。传感系统使用双功能磁珠捕获目标circRNA/miRNA复合物并进行信号放大。基于circRNA作为miRNA海绵的性质,仅当目标circRNA及其调节性miRNA作为复合物共存时,才能启动滚环扩增反应输出荧光信号。与对circRNA及其调节miRNA进行了单独分析的传统方法相比,该研究设计可表征两个相关RNA对特定cmRRI进行整合分析。此外,研究者还验证了该传感器直接检测生物样品中cmRRI的能力,揭示了该方法在未来的生物医学和临床研究中的应用前景。

 

 

图注:cmRRI检测方法原理流程图

 

2、多发性骨髓瘤细胞中全基因组环形RNA表达反映了对免疫调节药物的抗性。

标题:Genome-Wide Circular RNA Expression Patterns Reflect Resistance to Immunomodulatory Drugs in Multiple Myeloma Cells

杂志:Cancers (Basel). 影响因子:6.126

通讯作者:Lasse Sommer Kristensen奥尔胡斯大学

 

多发性骨髓瘤(MM)第二常见的血液系统恶性肿瘤,是由骨髓中浆细胞异常增殖引起的。 尽管已经观察到使用来那度胺和泊马利度胺等免疫调节药物(IMiDs)可能在多发性骨髓瘤(MM)患者中引起明显的缓解,但经常观察到复发,并且对此的潜在分子机制尚不完全清楚。环状RNA(circRNA)作为一类新兴的非编码RNA,在癌症中具有重要作用。该研究中作者概述了在单独或联合使用特定表观遗传药物处理的IMiD敏感MM细胞及其IMiD抵抗性细胞中circRNA的全基因组表达模式。结果发现,全基因组circRNA表达模式反映了IMiD敏感性,而ciRS-7(也称为CDR1as)是获得性耐药后下调最严重的circRNA。 ciRS-7的下调与其宿主基因LINC00632的启动子CpG岛的甲基化水平提高相关。 LINC00632和ciRS-7的表达可通过结合使用EZH2抑制剂(EPZ-6438)和DNA甲基转移酶抑制剂(5-氮杂胞苷)进行处理而部分恢复,同时也恢复了细胞对IMiD的敏感性。但是,敲低ciRS-7不会影响IMiD敏感性,研究者还发现ciRS-7在不暴露于药物后的长时间细胞培养中也发生表观遗传沉默。总之,该研究发现在获得性耐药的体外模型中全基因组circRNA表达模式反映了IMiD敏感性



图注:多发性骨髓瘤细胞中全基因组环形RNA表达

 

3、外泌体和外泌体microRNA在心血管疾病中的作用

标题:The Role of Exosomes and Exosomal MicroRNA in Cardiovascular Disease

杂志:Front Cell Dev Biol.Review 影响因子:5.201

通讯作者:刘克祥教授(吉林大学第二医院

 

外泌体是脂质膜双层包围的小囊泡(直径为30-150 nm),体内大多数细胞分泌。它们携带各种分子,包括蛋白质脂质mRNA和其他RNA种类,例如长非编码RNA,环状RNA和microRNA(miRNA)。 miRNA是外泌体中数量最多的传递分子。它们是大约19-22 nt长的内源性非编码RNA分子,是蛋白质生物合成的重要调节剂。外泌体可以被邻近或远处的细胞吸收,在那里它们通过靶向mRNA在转录后调控基因表达中发挥作用。外泌体miRNA具有多种功能,例如参与炎症反应细胞迁移增殖凋亡自噬和上皮-间质转化。越来越多的证据表明,外泌体miRNA在心血管健康中起着重要作用。外泌体miRNA广泛参与心血管疾病的发生和发展,例如动脉粥样硬化急性冠脉综合征心力衰竭(HF)心肌缺血再灌注损伤和肺动脉高压。在这篇综述中,作者提供了关于外泌体miRNA在心血管疾病中作用的研究进展的系统综述,并提出了诊断和治疗心血管疾病的新思路。

 

 


图注:外泌体miRNA形成、传递和功能机制示意图

 

文献列表

 

序号

主要内容

论文标题

杂志

影响因子

单位

1

开发用于分析circRNA-microRNA相互作用的二合一集成测定法

Development of a two-in-one integrated assay for the analysis of circRNA-microRNA interactions

Biosens Bioelectron.

10.257

南京大学等

2

从营养到花期生长的毛竹(Phyllostachys edulis)甲基化组和环状RNA随年龄相关变化的全基因组表征

Whole genome characterization of chronological age-associated changes in methylome and circular RNAs in moso bamboo (Phyllostachys edulis) from vegetative to floral growth

Plant J.

6.141

福建农林大学等

3

全基因组的环形RNA表达模式反映了对多发性骨髓瘤细胞中免疫调节药物的抗性。

Genome-Wide Circular RNA Expression Patterns Reflect Resistance to Immunomodulatory Drugs in Multiple Myeloma Cells

Cancers (Basel).

6.126

奥尔胡斯大学等

4

外泌体和外泌体microRNA在心血管疾病中的作用

The Role of Exosomes and Exosomal MicroRNA in Cardiovascular Disease

Front Cell Dev Biol.Review

5.201

吉林大学第二医院等

5

环形RNA hsa_circ_0004277刺激肝细胞癌的恶性表型和周围细胞的上皮-间质转化

Circular RNA hsa_circ_0004277 Stimulates Malignant Phenotype of Hepatocellular Carcinoma and Epithelial-Mesenchymal Transition of Peripheral Cells

Front Cell Dev Biol.

5.201

淮安市第一人民医院等

6

NF-κB上调环状RNA CircNOLC1通过miR-647/PAQR4轴促进前列腺癌的进展

Circular RNA CircNOLC1, Upregulated by NF-KappaB, Promotes the Progression of Prostate Cancer via miR-647/PAQR4 Axis

Front Cell Dev Biol.

5.201

南方医科大学珠江医院等

7

CircINSR调节胎牛肌肉和脂肪发育

CircINSR Regulates Fetal Bovine Muscle and Fat Development

Front Cell Dev Biol.

5.201

西北农林科技大学等

8

Juvenile单核细胞白血病中失调的CircRNA:CircMCTP1

CircRNAs Dysregulated in Juvenile Myelomonocytic Leukemia: CircMCTP1 Stands Out

Front Cell Dev Biol.

5.201

意大利帕多瓦大学等

9

Hsa_circ_0006571通过海绵化microRNA-138调节肺腺癌中sirtuin 1的表达促进脊髓转移

Hsa_circ_0006571 promotes spinal metastasis through sponging microRNA-138 to regulate sirtuin 1 expression in lung adenocarcinoma

Transl Lung Cancer Res.

5.132

上海中山医院等

10

年龄相关的衰老性白内障CircMRE11A_013与UBXN1结合并整合ATM活化增强晶状体上皮细胞

CircMRE11A_013 binds to UBXN1 and integrates ATM activation enhancing lens epithelial cells senescence in age-related cataract

Aging (Albany NY).

4.831

南通大学附属医院等

11

CircRNA_141539可通过吸附miR-4469和激活CDK3基因而成为食管鳞状细胞癌的致癌因子。

CircRNA_141539 can serve as an oncogenic factor in esophageal squamous cell carcinoma by sponging miR-4469 and activating CDK3 gene

Aging (Albany NY).

4.831

中国医科大学附属第一医院等

12

Hsa_circ_0000199通过干扰miR-206/613主导的PI3K/Akt/mTOR信号传导促进三阴性乳腺癌的化疗耐受性

Hsa_circ_0000199 facilitates chemo-tolerance of triple-negative breast cancer by interfering with miR-206/613-led PI3K/Akt/mTOR signaling

Aging (Albany NY).

4.831

复旦大学附属闵行医院等

13

抑郁症中的环状RNA:生物发生,功能,表达和治疗潜力

Circular RNAs in depression: Biogenesis, function, expression, and therapeutic potential

Biomed Pharmacother.Review

4.545

暨南大学中医学院等

14

环状RNA调节基因在胃癌竞争性内源RNA网络中的预后价值

The prognostic value of circular RNA regulatory genes in competitive endogenous RNA network in gastric cancer

Cancer Gene Ther.

4.534

中南大学湘雅第二医院等

15

环状RNA FLNA通过调节XRCC1和CYP1A1充当miR-486-3p的海绵,促进肺癌的进展

Circular RNA FLNA acts as a sponge of miR-486-3p in promoting lung cancer progression via regulating XRCC1 and CYP1A1

Cancer Gene Ther.

4.534

徐州医科大学附属医院等

16

心肌细胞增殖和心脏再生中的非编码RNA:解剖其治疗价值

Non-coding RNAs in cardiomyocyte proliferation and cardiac regeneration: Dissecting their therapeutic values

J Cell Mol Med.Review

4.486

浙江大学医学院等

17

circFOXO3:通过干扰miRNA调控网络来绕过癌症的机械网络

circFOXO3: going around the mechanistic networks in cancer by interfering with miRNAs regulatory networks

Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis.Review

4.352

罗马尼亚克卢日·纳波卡技术大学等

18

Hsa_circ_0010235通过调节miR-433-3p/TIPRL轴在非小细胞肺癌中起致癌作用

Hsa_circ_0010235 functions as an oncogenic drive in non-small cell lung cancer by modulating miR-433-3p/TIPRL axis

Cancer Cell Int.

4.175

郑州大学第一附属医院等

19

鉴定环状RNA表达谱和潜在的脑出血生物标志物

Identification of circular RNA expression profiles and potential biomarkers for intracerebral hemorrhage

Epigenomics.

4.112

北京协和医学院等

20

风险进展乳腺上皮3D培养模型显示Cx43/hsa_circ_0077755/miR-182作为增加乳腺癌发生风险的生物标志物轴

A risk progression breast epithelial 3D culture model reveals Cx43/hsa_circ_0077755/miR-182 as a biomarker axis for heightened risk of breast cancer initiation

Sci Rep.

3.998

贝鲁特美国大学等

21

水稻转录组的分析揭示了组织发育中的LncRNA/CircRNA调控。

Analysis of Rice Transcriptome Reveals the LncRNA/CircRNA Regulation in Tissue Development

Rice (N Y).

3.912

广西大学等

22

circRNA circ_102049通过靶向miR-455-3p激活CD80参与胰腺导管腺癌的进展

circRNA circ_102049 Implicates in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Progression through Activating CD80 by Targeting miR-455-3p

Mediators Inflamm.

3.758

台州中心医院等

23

上调的circRNA hsa_circ_0071036通过海绵miR-489促进胰腺癌的肿瘤发生,并预测不良特征和预后

Upregulated circRNA hsa_circ_0071036 promotes tumourigenesis of pancreatic cancer by sponging miR-489 and predicts unfavorable characteristics and prognosis

Cell Cycle.

3.699

上海中山医院等

24

环状RNA ITCH通过调节miR-199a-5p/Klotho轴抑制胃癌的转移

Circular RNA ITCH suppresses metastasis of gastric cancer via regulating miR-199a-5p/Klotho axis

Cell Cycle.

3.699

江苏大学医学部等

25

环形RNA hsa_circ_0001599的鉴定作为大动脉粥样硬化性中风的新型生物标志物

Identification of Circular RNA hsa_circ_0001599 As a Novel Biomarker for Large-Artery Atherosclerotic Stroke

DNA Cell Biol.

3.191

广东医科大学附属医院等

26

环状RNA CircMTO1通过miR-630/KLF6轴抑制骨肉瘤的增殖和转移

Circular RNA CircMTO1 suppressed proliferation and metastasis of osteosarcoma through miR-630/KLF6 axis

Eur Rev Med Pharmacol Sci.

3.024

西安交通大学医学院附属红会医院等

27

作者更正:心肌梗塞的人脐带间充质干细胞(UMSC)衍生的外泌体中的环状RNA 0001273

Author Correction: Circular RNA 0001273 in exosomes derived from human umbilical cord mesenchymal stem cells (UMSCs) in myocardial infarction

Eur Rev Med Pharmacol Sci.

3.024

青岛市中心医院等

28

Circ_0105346抑制基因通过调节miR-1182/WNT7B轴抑制骨肉瘤的发展

Circ_0105346 Knockdown Inhibits Osteosarcoma Development via Regulating miR-1182/WNT7B Axis

Cancer Manag Res.

2.886

山东中医药大学附属医院等

29

CircSKA3通过胶质母细胞瘤中的甲基化下调miR-1,以促进癌细胞增殖。

CircSKA3 Downregulates miR-1 Through Methylation in Glioblastoma to Promote Cancer Cell Proliferation

Cancer Manag Res.

2.886

暨南大学附属第一医院等

30

丙泊酚通过调节circ-ERBB2/miR-7-5p/FOXM1轴抑制肺癌的肿瘤发生

Propofol suppresses lung cancer tumorigenesis by modulating the circ-ERBB2/miR-7-5p/FOXM1 axis

Thorac Cancer.

2.61

河南省人民医院等

31

综合分析光气诱导的急性肺损伤中的mRNA,lncRNA和circRNA的差异表达

Comprehensive Analysis of the Profiles of Differentially Expressed mRNAs, lncRNAs, and circRNAs in Phosgene-Induced Acute Lung Injury

Biomed Res Int.

2.276

复旦大学附属金山医院等

32

Circ_0003998通过miR-136-5p/CORO1C轴调节抗DTX的非小细胞肺癌细胞的进程和多西他赛敏感性。

Circ_0003998 Regulates the Progression and Docetaxel Sensitivity of DTX-Resistant Non-Small Cell Lung Cancer Cells by the miR-136-5p/CORO1C Axis

Technol Cancer Res Treat.

2.074

山东省立第三医院等

33

环状RNA 0081146通过海绵化miR-144和上调HMGB1促进胃癌的发展

Circular RNA 0081146 facilitates the progression of gastric cancer by sponging miR-144 and up-regulating HMGB1

Biotechnol Lett.

1.977

上海中医药大学附属第七人民医院等

34

CircRNA_104565通过海绵miR-134促进乳头状甲状腺癌中的细胞增殖

CircRNA_104565 Promoted Cell Proliferation in Papillary Thyroid Carcinoma by Sponging miR-134

Int J Gen Med.

1.927

上海金山区亭林医院等

35

IgA肾病患者尿液外泌体环状RNA的差异表达分析

Differential expression analysis of urinary exosomal circular RNAs in patients with IgA nephropathy

Nephrology (Carlton).

1.749

吉林大学第二医院等

36

CircRNA circ_0004370通过miR-1301-3p/COL1A1轴促进食道癌的细胞增殖,迁移和侵袭并抑制细胞凋亡

CircRNA circ_0004370 promotes cell proliferation, migration, and invasion and inhibits cell apoptosis of esophageal cancer via miR-1301-3p/COL1A1 axis

Open Med (Wars).

1.204

昆明医科大学附属第一医院等

37

circRNA对动物骨骼肌发育的调控

circRNA on animal skeletal muscle development regulation

Yi Chuan

0

四川农业大学等