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技术前沿
circRNA研究汇总 | 20211115-1121
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2021-11-22 | 105 次浏览 | 分享到:

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计42篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract] 


1、急性髓系白血病中的环状RNAs


标题:Circular RNAs in acute myeloid leukemia

杂志:Mol Cancer

影响因子:27.401

通讯作者:Suresh Kumar Balasubramanian(韦恩州立大学Karmanos癌症研究所肿瘤学系)


尽管阐明AML分子基础的机制研究促进了几种新型靶向疗法的发展,但大多数AML患者仍然复发。因此,克服现有疗法固有的和后天的耐药性仍然是一个尚未解决的临床问题。虽然目前的诊断模式主要由大体形态学、细胞遗传学以及一定程度上的深度靶向基因测序来定义,但仍需要识别新的AML诊断、治疗和预后生物标志物。最近,人们对探索环状RNA(circRNA)在阐明AML生物学和治疗耐药性方面的作用很感兴趣。本综述在相同的科学前提下识别环状RNAs的进化作用,并试图确定其在调控AML方面的潜力。

环状RNA的生物发生机制


2、circHERC4可通过miR-556-5p/CTBP2/E-cadherin轴促进结直肠癌肿瘤转移


标题:Circular RNA circHERC4 as a novel oncogenic driver to promote tumor metastasis via the miR-556-5p/CTBP2/E-cadherin axis in colorectal cancer

杂志:J Hematol Oncol

影响因子:17.388

通讯作者:刘璐副主任医师,褚忠华副主任医师,尹东研究员(中山大学孙逸仙纪念医院)


背景:结直肠癌患者的主要死亡原因是转移。越来越多的证据表明,circRNA在癌症的发生和发展中起着关键作用。然而,协调癌症转移的CircRNAs的潜在分子机制仍然不明确,需要进一步澄清。


方法:采用两对大肠癌及癌旁正常组织,通过circRNAseq筛选上调的circRNAs;然后,应用细胞侵袭实验确认功能性侵袭相关的circRNAs。根据上述方法,选择circHERC4(hsa_circ_0007113)进行进一步研究。接下来,作者调查了大肠癌患者队列中circHERC4的临床意义。在大肠癌细胞系和动物异种移植研究中,研究了circHERC4的致癌活性。最后,作者探讨了circHERC4作为恶性驱动因素的分子机制。


结果:大肠癌组织中circHERC4异常升高(P<0.001),与淋巴结转移和晚期肿瘤分级呈正相关(P<0.01)。值得注意的是,circHERC4的表达与大肠癌患者较差的生存率相关。沉默circHERC4可显著抑制两种高侵袭性CRC细胞系的增殖和迁移,并减少体内肝和肺转移。如图1所示,作者发现circHERC4使肿瘤抑制因子miR-556-5p失活,导致CTBP2/E-cadherin通路激活,从而促进大肠癌的肿瘤转移。


结论:CircHERC4通过miR-556-5p/CTBP2/E-cadherin途径在促进肿瘤侵袭性方面发挥关键作用,是该疾病的预后生物标志物,提示CircHERC4可能是大肠癌患者可开发的治疗靶点。


图1.circHERC4参与大肠癌发病和转移的机制


3、基因座保守的环状RNA cZNF292控制内皮细胞血流反应


标题:Locus-Conserved Circular RNA cZNF292 Controls Endothelial Cell Flow Responses

杂志:Circ Res

影响因子:17.367

通讯作者: Stefanie Dimmeler(德国法兰克福大学心血管再生研究所)


背景:环状RNAs(circRNAs)是由大多数mRNAs的反向剪接产生的,作为一类控制各种细胞功能的新型调节性RNAs,正受到越来越多的关注。然而,鉴于其基因失活的固有挑战,它们在体内的生理作用和功能保护很少得到解决。在这里,我们的目的是在小鼠和人类中鉴定位点保守的CircRNAs,这些CircRNAs由于保留了mRNA宿主基因中不包含的内含子元件而被遗传删除,从而最终解决功能保守问题。


方法:在机制上,作者通过RNA亲和纯化和随后的质谱分析鉴定了与内皮细胞中cZNF292特异性相互作用的蛋白连接体(SDOS)。SDOS或其蛋白结合伙伴Syndecan-4的沉默,或SDOS-cZNF292结合位点的突变,阻止层流诱导的细胞骨架重组,从而重现cZfp292表型。


结果:结合已发表的内皮细胞RNA测序数据集和circATLAS数据库的circRNAs,作者在小鼠和人类之间鉴定了保留内含子元件的位点保守的circRNA。CRISPR/Cas9介导的顶端表达的circRNA cZfp292基因缺失导致体内主动脉内皮细胞形态改变和血流排列异常。体外内皮细胞中cZNF292的缺失消除了层流诱导的细胞定向、帕西林定位和粘着组织的改变。


结论:如图2所示,作者的数据揭示了cZNF292/cZfp292在内皮血流反应中的作用,该作用影响内皮的形状。   


图2. cZNF292影响内皮细胞形态的机制


参考文献列表