标题摘要内容
RNA sequencing
小RNA测序
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2017-09-02 | 3731 次浏览 | 分享到:

RNA是指一类高度保守的长度为18-32ntRNA分子,主要包括miRNAsiRNAsnoRNApiRNA等,是生命活动重要的调控因子,在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。研究表明, 包括癌症、心血管疾病、免疫系统疾病在内的多种疾病与miRNA 的调控作用密切相关。近年来, 由于小RNA测序技术的应用,越来越多的miRNA被发现和功能鉴定,并将广泛应用于疾病诊断、个性化治疗和预后等领域。

 

技术路线

 

样品要求


• 样品类型:细胞、新鲜组织FFPE组织、血液RNA、血清血浆RNA外泌体RNA样品等。

• 物种:人、大小鼠(特殊物种详询技术支持)

具体样品量要求及样本采集、保存和运输方法请参照附录一。

 

测序方案

测序模式 PE150

测序数据量 10M reads


生物信息分析内容

1 miRNA测序分析

2 原始数据质控检查;

3 比对结果质控检查

4 miRNA预测

5 ncRNA注释(rRNA / tRNA / snRNA / snoRNA /piRNA

6 基于miRNA表达的样品主成分分析

7 miRNA差异分析

8 差异miRNA靶基因GO功能分析

9 差异miRNA靶基因通路分析

10 差异miRNA与差异表达基因调控分析(如果有mRNA测序结果)

11 差异miRNA与差异表达基因网络绘图(如果有mRNA测序结果)



高通量测序附录

高通量测序