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RNA sequencing
微量RNA测序
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2017-09-02 | 3260 次浏览 | 分享到:

目前,常规高通量测序建库对样品量的要求较高,许多来源稀少的细胞样品、exosome样品、肿瘤等临床样品以及一些提取困难、容易降解的特殊样品等由于难以获得足量的核酸而无法进行常规建库测序。吉赛生物在丰富的核酸抽提经验的基础上,结合领先的文库构建策略,同时推出微量RNA(<10ng)测序,为客户提供更全面的测序服务和更专业的数据分析报告。

 

技术路线

 

样本要求

• 样品类型:微量RNA样品

• 样品量:小于10 ng

样品保存:RNA溶于RNase Free 的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。

• 样品运输:样品置于1.5 mL管中,封口膜封好,冷冻运输。

 

测序方案

测序模式 PE150

测序数据量 10Gb clean data

 

生物信息分析内容

基础分析  

原始数据质控检查

比对结果质控检查

基于基因表达的样品主成分分析

差异基因表达及相关通路富集分析

5 circRNA预测及鉴定

6 circRNA差异分析

差异circRNA宿主基因的通路富集分析

差异circRNA的靶向miRNA预测分析

长链非编码RNA差异分析

 

高级分析 

10 基于基因表达的通路活性分析  

11 转录调控活性分析及通路互作分析

12 差异长链非编码RNA的调控基因的通路富集分析

13 circRNA及靶向miRNA网络调控制图


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高通量测序