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DNA sequencing
RRBS甲基化测序
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2017-09-02 | 5276 次浏览 | 分享到:



        DNA甲基化研究一直是疾病研究的热点,与基因表达、表型性状息息相关。是基因调控的手段之一,通过对位于启动子及第一外显子区的CpG岛的甲基化而抑制基因的表达。在维持细胞正常功能、传递基因组印记,胚胎发育、肿瘤发生等方面起着至关重要的作用。      


        RRBSReduced Representation Bisulfite Sequencing)是一种准确且高性价比的DNA甲基化研究方法,在大规模临床样本的研究中有着广泛的应用。RRBS通过限制性内切酶对基因组进行酶切,富集启动子及CpG岛区域,再进行Bisulfite转化,用较小的数据量得到包含最多CpG位点甲基化信息的单碱基精度的甲基化图谱。

 

 

RRBS技术路线图

 

样品要求

• 样品类型:细胞、新鲜组织或DNA样品。

• 物种

具体样品量要求及样本采集、保存和运输方法请参照附录二。

 

测序方案

测序模式 PE150

测序数据量 7.5Gb

 

生物信息分析内容

1 原始数据质控检查;

2 甲基化序列比对结果分析;

3 测序深度及覆盖度统计;

4 计算C碱基的甲基化水平;

5 DNA甲基化信号在基因组的分布;

6 DNA甲基化信号的基因组元件注释;

7 DNA甲基化图谱绘制;

8 差异甲基化区域分析;


高通量测序附录

高通量测序