Exosome(外泌体)是活细胞分泌的来源于晚期核内体(也称为多囊泡体)的膜性囊泡,存在于体液中,包括血液、唾液、尿液和母乳等。目前研究发现,exosome内含有与细胞来源相关的蛋白质、脂质和各类核酸分子,尤其是miRNA和lncRNA。Exosome能够通过生物屏障,在细胞间传递功能性核酸分子,从而发挥各种生物学功能,有望成为一种新型给药途径及基因治疗载体。
吉赛生物提供外泌体提取试剂盒,能够快速分离提取exosome RNA进行建库测序,满足外泌体mRNA,lncRNA,circRNA,miRNA的不同研究需求。
技术路线
样本要求
样品类型:血清、血浆、尿液、或细胞上清液等
物种:人、大小鼠(特殊物种详询技术支持)
具体样品量要求及样本采集、保存和运输方法请参照附录一。
测序方案
分析对象:mRNA+lncRNA+circRNA
测序模式 PE150
测序数据量 10 Gb
分析对象:miRNA
测序模式 PE150
测序数据量 10 M reads
长链转录组分析内容
1 原始数据质控检查
2 比对结果质控检查
3 基于基因表达的样品主成分分析
4 差异基因表达及相关通路富集分析
5 circRNA预测及鉴定
6 circRNA差异分析
7 差异circRNA宿主基因的通路富集分析
8 差异circRNA的靶向miRNA预测分析
9 长链非编码RNA差异分析
10 基于基因表达的通路活性分析
11 转录调控活性分析及通路互作分析
12 差异长链非编码RNA的调控基因的通路富集分析
13 circRNA及靶向miRNA网络调控制图
miRNA分析内容
1 miRNA测序分析
2 原始数据质控检查
3 比对结果质控检查
4 新miRNA预测
5 ncRNA注释(rRNA / tRNA / snRNA / snoRNA / piRNA)
6 基于miRNA表达的样品主成分分析
7 miRNA差异分析
8 差异miRNA靶基因GO功能分析
9 差异miRNA靶基因通路分析
10 差异miRNA与差异表达基因调控分析(如果有mRNA测序结果)