m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺苷)是真核生物中最常见最丰富的RNA修饰,作为一种可逆修饰,RNA既可以在甲基化转移酶METTL3/14 等酶的作用下发生m6A甲基化修饰,又可以在FTO、ALKBH5等酶的作用下发生去甲基化修饰;另外,它能够通过YTHDC1/2 等m6A 识别因子发挥重要功能,例如目前已发现 m6A 在调控基因表达、剪接、RNA编辑、RNA稳定性、控制mRNA寿命和降解、介导环状RNA翻译等方面扮演重要角色 。
circRNA 作为一类新的 RNA 分子,也被发现存在大量 m6A 修饰,并且与线性 RNA 共享相同的 Writers 和 Readers 但具有不同的表达模式。m6A 对 circRNA 的生命活动具有重要的调控功能,包括m6A 能够介导 circRNA 的形成。
目前对m6A的转录组研究的主要方法为MeRIP-seq(methylated RNA immunoprecipitation sequencing),其原理是通过m6A特异性抗体识别并结合具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,对富集下来的RNA片段进行高通量测序。结合生物信息学分析,即可在全转录组范围内对m6A修饰进行系统研究。
样品类型:细胞或组织,total RNA。
物种:哺乳动物细胞或组织(有参考基因组且注释信息完整)
具体样品量要求及样本采集、保存和运输方法请咨询技术支持。
测序模式 PE150
测序数据量 12Gb raw data
RIP 富集分布分析
m6A 全基因组分布分析
m6A的元基因分析
m6A 特定基因丰度展示
KEGG通路富集分析
Motif分析
m6A和转录组关联分析
案例1
案例2