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自主产品
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Ribomoval rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)
来源:
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作者:geneseed
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发布时间: 2020-11-10
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产品简介
RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) 采用RNase H消化法去除人、小鼠和大鼠Total RNA中的核糖体RNA（包括28S、18S、5.8S、5S和线粒体rRNA 16S、12S），保留mRNA和其他非编码RNA信息（lncRNA、circRNA等）。本试剂盒对于完整和部分降解的RNA均有良好的rRNA去除效果，经rRNA去除所获得的RNA可用于mRNA和非编码RNA的高通量测序分析，能显著提高测序结果中有效数据比例。
原理示意图
原理示意图
适用范围
适用于人、小鼠或大鼠来源的0.1~1 μg Total RNA样本。
运输与保存
-30℃~ -15℃保存。干冰运输。
产品特点
样品广泛：对于完整和部分降解的RNA均有良好的rRNA去除效果。
高效去除：可有效去除人/小鼠/大鼠的95%-99.9%的rRNA。
数据全面：保留mRNA和其他非编码RNA信息（lncRNA、circRNA等），使转录组数据更加全面。
高效去除：可有效去除人/小鼠/大鼠的95%-99.9%的rRNA。
数据全面：保留mRNA和其他非编码RNA信息（lncRNA、circRNA等），使转录组数据更加全面。
产品组分
注：试剂盒中各组分试剂按照标注体积的110%提供。
注意事项
1、为保证rRNA去除效率， RNA样品不应含有盐离子 (例如Mg2+或胍盐) 和有机物 (例如苯酚和乙醇)。
2、RNA样品不应有基因组DNA污染，若样品中有gDNA残留，应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。
3、RNA样品最大投入体积为10 μL，若样品体积较大，可先进行RNA样品浓缩。
4、用于RNA-Seq的样品，建议TotalRNA起始量应高于100 ng，以增加文库的复杂性。
1、为保证rRNA去除效率， RNA样品不应含有盐离子 (例如Mg2+或胍盐) 和有机物 (例如苯酚和乙醇)。
2、RNA样品不应有基因组DNA污染，若样品中有gDNA残留，应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。
3、RNA样品最大投入体积为10 μL，若样品体积较大，可先进行RNA样品浓缩。
4、用于RNA-Seq的样品，建议TotalRNA起始量应高于100 ng，以增加文库的复杂性。
案例展示
研究一、qPCR检测RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Geneseed) 对rRNA去除效果
实验各取三份1 μg Human/Mouse/Rat total RNA样品，用Ribomoval rRNA Depletion Kit及K company试剂盒进行rRNA去除对比研究，然后采用qPCR方法对rRNA去除前后的rRNA和mRNA基因的表达量进行检测。
1、RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Geneseed) 去除rRNA效果显著
1、RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Geneseed) 去除rRNA效果显著
图1 qPCR检测rRNA表达量的变化
图1显示Human/Mouse/Rat total RNA样品经Ribomoval rRNA Depletion Kit去除rRNA后，其rRNA基因的表达量CT值显著大于未经rRNA去除的，Ribomoval rRNA Depletion Kit去除rRNA效果显著，去除效率可高达99.99%。同时与K company试剂盒对比，Ribomoval rRNA Depletion Kit去除rRNA效果更优。
2、RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Geneseed) 对mRNA无影响
2、RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Geneseed) 对mRNA无影响
图2 qPCR检测GAPDH表达量的变化
图2显示Human/Mouse/Rat total RNA样品经Ribomoval rRNA Depletion Kit有效去除rRNA的过程未影响mRNA（GAPDH为mRNA管家基因），去除rRNA后样本的GAPDH基因表达量CT值与未去除rRNA样本的基本不变，说明rRNA被去除，而mRNA被保留。同时mRNA在Ribomoval rRNA Depletion Kit及 K company试剂盒处理下的稳定性相当。
研究二、核酸分析仪验证RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Geneseed) 对rRNA去除效果
图3 Human/Mouse/Rat样本核酸分析仪的质检结果
研究三、高通量测序验证RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Geneseed) 对rRNA去除效果
研究二、核酸分析仪验证RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Geneseed) 对rRNA去除效果
图3 Human/Mouse/Rat样本核酸分析仪的质检结果
图3展示 ( 由上到下) 分别是Human/Mouse/Rat total RNA样品进行rRNA去除后的28S、18S和5S的峰图与total RNA进行对比，说明Ribomoval rRNA Depletion Kit可去除几乎所有的rRNA，去除效果显著。
研究三、高通量测序验证RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Geneseed) 对rRNA去除效果
实验各取三份1 μg和0.1 μg Human/Mouse/Rat total RNA，用Ribomoval rRNA Depletion Kit及K company试剂盒进行rRNA去除对比研究，对未进行rRNA去除与rRNA去除后的样品构建文库测序，然后与其基因组数据库进行对比。
图4 rRNA残留率比较图
图4 显示Ribomoval rRNA Depletion Kit对1 μg 和0.1 μg Human/Mouse/Rat total RNA中的rRNA均有显著去除效果。同时与K company试剂盒对比，Ribomoval rRNA Depletion Kit的rRNA残留率更低，去除效果更优。
通过以上的研究对比分析可以看出，RibomovalTM rRNA Depletion Kit的整体性能优于市面上的主流产品，对于完整和部分降解的RNA均有良好的rRNA去除效果，经rRNA去除所获得的RNA可用于mRNA和非编码RNA的高通量测序分析，能显著提高测序结果中有效数据比例，是RNA文库构建中去除rRNA的优选。
通过以上的研究对比分析可以看出，RibomovalTM rRNA Depletion Kit的整体性能优于市面上的主流产品，对于完整和部分降解的RNA均有良好的rRNA去除效果，经rRNA去除所获得的RNA可用于mRNA和非编码RNA的高通量测序分析，能显著提高测序结果中有效数据比例，是RNA文库构建中去除rRNA的优选。
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