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RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2020-11-10 | 312 次浏览 | 分享到:

产品简介
RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) 采用RNase H消化去除人、小鼠和大鼠Total RNA中的细胞质rRNA(28S、18S、5S)和线粒体rRNA(16S、12S、5.8S),以保留circRNA、mRNA和其他非编码RNA。本试剂盒对于完整和部分降解的RNA(FFPE RNA)均有良好的rRNA去除效果,经rRNA去除所获得的RNA可用于高通量测序分析,能显著提高测序结果中有效数据比例。



适用范围
适用于人、小鼠或大鼠来源的0.1~1 μg Total RNA样本。

产品特点
样品广泛:对于完整和部分降解的RNA(FFPE RNA)均有良好的rRNA去除效果。
高效去除:可有效去除人/小鼠/大鼠的95%~99.9%的rRNA。
数据全面:保留circRNA、mRNA和其他非编码RNA信息,使转录组数据更加全面。

产品组分

注:试剂盒中各组分试剂按照标注体积的110%提供。
运输与保存
干冰运输,-30℃~ -15℃ 保存,有效期一年。

案例展示
一、 rRNA去除效果对比
分别使用1 μg Human/Mouse/Rat RNA样品进行rRNA去除,使用qPCR检测对比去除前后rRNA基因和mRNA基因的表达量变化。
图1显示Human/Mouse/Rat RNA样品经rRNA去除后,rRNA基因的表达量CT值远大于未经rRNA去除的,说明rRNA去除成功。本试剂盒(Geneseed)与K company的效果相当,优于Q company的去除效果。

图1  rRNA基因的表达量变化

    图2显示Human/Mouse/Rat RNA样品经rRNA去除后,mRNA基因的表达量CT值在去除前后基本不变,说明rRNA被去除,而circRNA、mRNA和其他非编码RNA被保留。本试剂盒(Geneseed)与K company和Q company的效果相当。

图2  mRNA基因的表达量变化

二、 rRNA残留率对比
分别使用1 μg 和0.1 μg universal human reference RNA 进行rRNA去除,构建文库测序后与人类基因组数据库hg19进行比对。
图3显示经rRNA去除后,rRNA残留率低于5%,本试剂盒(Geneseed)比K company的残留率更低。

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