真核生物mRNA测序的研究对象为特定细胞或组织在某一功能状态下转录出来的mRNA集合，通过oligo-dT磁珠捕获带polyA尾的RNA进行建库测序，也称为PolyA-Seq。可研究mRNA差异表达或检测结构变异，筛选与疾病或性状相关的分子标记；还可揭示转录组的复杂性，确定基因以及转录本结构、可变剪接、RNA编辑、带polyA尾的非编码RNA 和新转录本。目前已广泛应用于基础研究、分子育种、临床诊断和药物研发等领域。

技术路线

样品要求

        样品类型：细胞、新鲜组织或完整性良好的Total RNA样品。

        物种：真核生物（详询技术支持）

        具体样品量要求及样本采集、保存和运输方法请参照附录一。

测序方案

        测序模式 PE150

        测序数据量 5Gb 

生物信息分析内容

        1 原始数据质控检查

        2 比对结果质控检查

        3 基于基因表达的样品主成分分析

        4 差异基因表达分析

        5 差异基因GO功能分析

        6 差异基因通路分析

        7 变异剪切分析 （40M pair end reads）

        8 基因突变分析（40M pair end reads）

        9 转录调控活性分析及通路互作分析

吉赛生物NGS样本采集、保存、运输要求（2020年version2.2）