小RNA是指一类高度保守的长度为18-32nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA、snoRNA和piRNA等,是生命活动重要的调控因子,在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。研究表明, 包括癌症、心血管疾病、免疫系统疾病在内的多种疾病与miRNA 的调控作用密切相关。近年来, 由于小RNA测序技术的应用,越来越多的miRNA被发现和功能鉴定,并将广泛应用于疾病诊断、个性化治疗和预后等领域。
技术路线
样品要求
样品类型:细胞、新鲜组织、FFPE组织、血液RNA、血清血浆RNA或外泌体RNA样品等。
物种:人、大小鼠(特殊物种详询技术支持)
具体样品量要求及样本采集、保存和运输方法请参照附录一。
测序方案
测序模式 PE150
测序数据量 10M reads
生物信息分析内容
1 miRNA测序分析
2 原始数据质控检查;
3 比对结果质控检查
4 新miRNA预测
5 ncRNA注释(rRNA / tRNA / snRNA / snoRNA /piRNA)
6 基于miRNA表达的样品主成分分析
7 miRNA差异分析
8 差异miRNA靶基因GO功能分析
9 差异miRNA靶基因通路分析
10 差异miRNA与差异表达基因调控分析(如果有mRNA测序结果)
11 差异miRNA与差异表达基因网络绘图(如果有mRNA测序结果)