宏基因组（Metagenome）是环境中全部微小生物遗传物质的总和，它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因组。宏基因组测序是指对微生物群体进行高通量测序，通过测序数据分析特定环境中微生物群体基因组成及功能，研究微生物多样性、种群结构、生物进化与环境之间的关系，解读微生物群体多样性与丰度，微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因，挖掘具有应用价值的基因资源，应用于开发新的微生物活性物质。

技术路线

样品要求

• 样品类型：Meta样品，如粪便、土壤等或Meta DNA样品。

• 物种：常见有参微生物（详询技术支持）

•具体样品量要求及样本采集、保存和运输方法请参照附录二。

测序方案

测序模式 PE150

测序数据量 5-10Gb

生物信息分析内容

基础分析  

1 物种组成和丰度统计；

2 样品复杂度分析；

3 样品间物种丰度差异分析；

4 基因组组装；

5 基因组组分分析；

6 基因功能GO-COG注释；

7 基因功能KOG，KEGG注释；

高级分析 

8 多样品显著相关因子分析；

9 与疾病相关的基因的深度分析；

10 菌群共生关系网络构建；
11 系统进化树构建；

吉赛生物NGS样本采集、保存、运输要求（2020年version2.2）