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circRNA注释及功能预测
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2019-03-12 | 3301 次浏览 | 分享到:
        circRNA 在各种生物中广泛表达,具有种属、组织、疾病及发育阶段相关的特异性,与各种疾病,尤其是恶性肿瘤的发生发展密切相关。circRNA不仅作为海绵吸附 miRNA 发挥生物学功能,同时还具有调控转录和转录后过程、可变剪接、编码蛋白以及充当蛋白诱饵等作用[1,2,3,4]。我们采用多种权威算法预测circRNA的全面功能,目前关于人类的circRNA基本注释及序列信息、miRNA结合预测、翻译蛋白预测、小鼠保守性预测、Cosmic突变和M6a甲基化修饰等资源已经整合到circBank数据库,欢迎大家使用。

Circbank数据库主要包含以下几方面功能:
1.circRNA基因全新命名;
2.circRNA基因基本特征注释信息;
3.circRNA序列检索提取功能;
4.circRNA结合miRNA预测;
5.circRNA翻译蛋白潜能的预测评估;
6.circRNA基因序列保守性分析结果;
7.circRNA转录后修饰信息;
网址:http://www.circbank.cn/

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