生物信息分析内容

基础分析

原始数据质控检查（碱基质量评估，序列质量评估）

比对结果质控

reads 在基因组上的分布分析

基因覆盖度分析

翻译图谱刻画：P-site定义确认

翻译图谱刻画：ORFs统计与对应的氨基酸序列分析

高级分析（有不同处理条件分组样本）

翻译组差异基因表达分析

翻译组差异基因GO功能分析

翻译组差异基因KEGG通路分析

翻译组差异基因Rectome通路分析

circRNA翻译事件识别分析

翻译组差异circRNA宿主基因GO功能分析

翻译组差异circRNA宿主基因KEGG通路分析

翻译组差异circRNA宿主基因Rectome通路分析

翻译组差异circRNA的靶向miRNA预测分析

翻译组差异circRNA及靶向miRNA网络调控制图

差异circRNA翻译潜能预测分析(CPAT预测，IRES预测和ORF预测）

个性化分析（需要同时做RNA-seq，结合RNA-seq数据分析）

TE翻译效率分析

差异TE基因表达分析

差异TE基因聚类分析

差异TE基因GO/KEGG富集分析

部分结果展示

Figure1. P-site 评估样图

Figure2. ORF类型数量统计图

Figure3. Riboseq差异表达基因的火山图

Table1. Ribo-seq原始样本送样建议

*翻译组测序的细胞样本处理方法和转录组测序不一样，具体处理、保存和运输方法请咨询技术支持。

物种范围：人、小鼠、大鼠，其他物种请详询销售或技术支持

Q1：为什么Trizol裂解的细胞不能做翻译组测序？

A1：翻译组测序实验是从细胞或组织开始的，而不是从总RNA开始的。为获取体内核糖体结合mRNA的真实情况，通常在裂解细胞前，会使用Cycloheximide（放线菌酮）来抑制翻译延伸。如果没有用专用的裂解液而是用Trizol裂解细胞，trizol会破坏核糖体和RNA结合的状态，无法获得RFPs，翻译组测序也就做不了。

Q2：只做Riboseq，不做RNA-seq可以分析翻译效率吗？

A2：不可以

翻译效率TE的计算ORF 序列长度标准化后的核糖体捕获片段数目 / 转录本序列长度标准化后的RNA-seq 片段数

如果没有转录组测序的数据，无法进行计算。