circRNA qPCR引物设计circRNA qPCR检测circRNA表达分析circRNA过表达实验circRNA干扰实验细胞功能实验慢病毒包装circRNA功能分析T系列-circRNA翻译验证R系列-IRES活性检测circRNA翻译-验证研究circRNA注释及功能预测circRNA荧光素酶报告检测circRNA RIP实验circRNA pull-down实验circRNA相互作用组学研究circRNA FISH探针合成circRNA定位分析circRNA全长纳米孔测序 | ONT circRNA full-length Sequencin三代测序全转录组测序 | RNA-seqcircRNA测序 | circRNA-seqmRNA测序 | mRNA-seq小RNA测序 | miRNA-seq转录组学研究核糖体印迹测序 | Ribo-seq核糖体-新生肽链复合物测序 | RNC-seq翻译组学研究RNA m6A甲基化测序 | MeRIP-Seq染色质开放性测序 | ATAC-seq表观组学研究10×Visium空间转录组测序空间转录组学研究外泌体RNA测序 | Exosome RNA-seq外泌体提取及鉴定外泌体研究RNA免疫共沉淀测序 | RIP-seq染色质免疫共沉淀测序 | ChIP-seq核酸蛋白互作研究微生物宏基因组测序 | Metagenomics Sequencing基因组学研究生物医学大数据挖掘分析circRNA定制化分析及绘图常规组学及多组学联合分析单细胞测序数据生信分析生物信息学分析服务RNase RcircRNA qRT-PCR试剂盒circRNA检测circRNA过表达系列circRNA过表达载体系列血液基因组DNA提取试剂盒全血RNA提取试剂盒细胞RNA提取试剂盒核酸提取与纯化RNA pull-down试剂盒RIP试剂盒T7转录试剂盒(生物素标记)分子互作系列外泌体提取试剂盒Taqman探针法支原体检测试剂盒(UNG防污染版)支原体检测核糖体RNA去除试剂盒(人/大鼠/小鼠)核糖体RNA去除试剂盒(植物)RNA-seq文库构建试剂盒RNA建库接头试剂DNA磁珠RNA磁珠高通量测序系列circRNA标准品系列CircLucT7耐高温高产量RNA合成试剂盒环状RNA合成试剂盒T4 RNA连接酶1T4 RNA连接酶2circRNA制备系列原位杂交系列原位杂交系列
小RNA测序 | miRNA-seq
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常见问题

RNA主要包括miRNAsiRNAsnoRNApiRNA等,是生命活动重要的调控因子,在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。由于小RNA测序技术的应用,越来越多的miRNA被发现和鉴定并广泛应用于疾病诊断、个性化治疗和预后等领域。


图片1.png

RNA测序技术路线

测序方案
测序平台Illumina Novaseq 6000

测序模式PE150

测序数据量10 M raw reads








生物信息分析

基础分析

原始数据质控检查(碱基质量评估,序列质量评估)

比对结果质控检查

RNA种类分析统计

miRNA表达分析

基于miRNA表达的样品主成分分析

miRNA差异分析

差异 miRNA 靶基因预测

差异 miRNA 靶基因的GO功能分析

差异 miRNA 靶基因的KEGG通路分析

差异 miRNA 靶基因的Rectome通路分析


高级分析(可结合mRNA测序结果)

差异miRNA与差异表达基因调控分析

差异miRNA与差异表达基因网络绘图


部分结果展示

1外泌体中共表达和特异性表达的miRNAs维恩图


2火山图展示HFD-exosNCD-exos的表达差异倍数


3miRNA靶基因网络图




Table1. miRNA-seq原始样本送样建议

送样类型

送样量

备注

细胞上清

≥30mL

无支原体污染

血清、血浆

≥4mL


Table2. miRNA-seq RNA样本送样建议

送样类型

送样量

完整性(RIN值)

浓度

其他

纯度

total RNA

≥1μg

≥7

≥100ng/μl


无DNA,蛋白/盐离子等污染,样本无色透明不粘稠

血清血浆、细胞上清、外泌体RNA

≥40ng

/

/

DV200>30%

FFPE组织RNA

≥4μg

≥3

/

DV200>30%

RIP RNA、pulldown RNA

≥200ng,如≤10ng,则采用微量建库

/

/


*更具体的送样方法请详询销售或技术支持

物种范围:人、小鼠、大鼠等物种,其余物种请详询销售或技术支持








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