ATAC-seq + RNA-seq 关联分析

        DNA调控元件活性的一个特征就是染色质可接近性，只有活跃的调控元件才能被细胞机制识别表达，因此，染色质的可接近性与转录调控密切相关。ATAC-seq 可以得到某一时空下全基因组染色质开放区域，RNA-seq可以得到同一时空下基因表达信息，通过联合两个组学的数据，可以获得该时空下影响基因表达的的上游调控区域；并且调控元件富集数据与基因表达数据能相互验证。

        2016年6月，清华大学的颉伟老师领导的团队在国际顶级学术期刊《Nature》发表了染色质可接近性研究（IF：40.137），可以说是用ATAC-seq寻找关键转录因子的经典教材。该文章联合ATAC-seq和RNA-seq检测了早期胚胎发育过程中各时期染色质结构开放区域的动态变化，发现不同时期的细胞开放区域的动态变化情况，并得到胚胎发育时期关键转录因子，绘制出了小鼠早期胚胎中全基因组易接近性染色质图谱。

Nature, 2016, 534(7609): 652-7.

Figure1.小鼠着床前胚胎细胞染色质开放性可视图

Nature, 2016, 534(7609): 652-7.

Figure2.胚胎发育过程各时期关键调控元件及转录因子预测结果

        ATAC-seq技术是一种快速和灵敏的表观基因组学研究方法，只需要少量细胞即可捕获全基因组活性调控序列。因此，对于临床上珍贵而稀少的细胞样本（如胚胎细胞）的染色质状态的研究就显得非常有利而重要，并且能够很好的推进染色质可接近性研究在基础研究与临床开发中的应用。

Table1.ATAC-seq原始样本送样建议

*更具体的送样方法请详询销售或技术支持

物种范围：人、小鼠、大鼠，其他物种请咨询销售或技术支持