|
circRNA技术服务
高通量测序服务
|
组织切片的细胞中会释放出mRNA，通过poly-T捕获带有poly-A的mRNA，迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列，然后进行文库构建并测序。最后，根据数据的条形码信息对数据进行分析，以确定哪些数据来自哪个位置，从而实现空间基因表达的可视化。
10×Visium空间转录组测序技术路线
测序方案 测序模式：PE150 测序数据量：≥50 k reads pairs per spot 生物信息分析 原始序列数据 测序数据质量评估过滤 Spot质控 数据比对 数据标准化 Spot聚类分群 Spot亚群分析 Marker分析 细胞类型鉴定 解剖区域注释 细胞通讯分析 样本间差异分析 注释区域间差异分析 部分结果示例
图1.Spot聚类与图像整合 |
送样类型 | 送样量 | 备注 |
新鲜组织 | OCT冷冻包埋送样；组织大小建议6.5mm^3 | 包埋模具上表明组织的方向，以便后续确认切片方向 |
FFPE | 包埋组织大小建议6.5mm^3 | DV200>50% |
*皮肤、胰腺以及骨头组织暂时不适进行空间转录组测序，更具体的送样方法请详询销售或技术支持
物种范围：人、小鼠、大鼠，其他物种请咨询销售或技术支持
地址：广州科学城掬泉路 3 号国际企业孵化器 D 区 706-707
版权所有： 广州吉赛生物科技股份有限公司 Copyright 2014 All Rights
备案号：粤ICP备16055576号-1
