circRNA技术服务
高通量测序服务
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组织切片的细胞中会释放出mRNA,通过poly-T捕获带有poly-A的mRNA,迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列,然后进行文库构建并测序。最后,根据数据的条形码信息对数据进行分析,以确定哪些数据来自哪个位置,从而实现空间基因表达的可视化。
10×Visium空间转录组测序技术路线
测序方案 测序模式:PE150 测序数据量:≥50 k reads pairs per spot 生物信息分析 原始序列数据 测序数据质量评估过滤 Spot质控 数据比对 数据标准化 Spot聚类分群 Spot亚群分析 Marker分析 细胞类型鉴定 解剖区域注释 细胞通讯分析 样本间差异分析 注释区域间差异分析 部分结果示例图1.Spot聚类与图像整合 图2.小鼠大脑空间分辨率的基因表达模式图 图3.图1小鼠肾脏空间转录组的mRNA表达及聚类图 Table.空间转录组原始样本送样建议
*皮肤、胰腺以及骨头组织暂时不适进行空间转录组测序,更具体的送样方法请详询销售或技术支持 物种范围:人、小鼠、大鼠,其他物种请咨询销售或技术支持 |