circRNA技术服务
高通量测序服务
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Exosome能够通过生物屏障,在细胞间传递功能性核酸分子,从而发挥各种生物学功能,有望成为一种新型给药途径及基因治疗载体。吉赛生物自主研发外泌体提取试剂盒,能够快速分离提取exosome RNA进行建库测序,满足外泌体mRNA,lncRNA,circRNA,miRNA的不同研究需求。 外泌体RNA测序技术路线
测序方案 分析对象:mRNA+lncRNA+circRNA 测序平台:Illumina Novaseq 6000 测序模式:PE150 测序数据量:10 Gb raw data
测序平台:Illumina Novaseq 6000 测序模式:PE150 测序数据量:10 M raw reads 生物信息分析 外泌体全转录组测序 |exo-RNA-seq(mRNA+lncRNA+circRNA) 基础分析 原始数据质控检查 比对结果质控检查 基因覆盖度分析 基于基因表达的样品主成分分析 基因表达分析 circRNA预测及鉴定 长链非编码RNA的识别 高级分析 差异基因表达分析 差异基因GO功能分析 差异基因KEGG通路分析 差异基因Rectome通路分析 针对mRNA基因的GSEA分析 circRNA差异分析 差异circRNA宿主基因的GO功能分析 差异circRNA宿主基因的KEGG通路分析 差异circRNA宿主基因的Rectome通路分析 差异circRNA的靶向miRNA预测分析 差异circRNA及靶向miRNA网络调控制图 长链非编码RNA的识别 长链非编码RNA差异分析 差异lncRNA顺式调控基因的GO功能分析 差异lncRNA顺式调控基因的KEGG通路分析 差异lncRNA顺式调控基因的Rectome通路分析
外泌体miRNA测序|exo-miRNA-seq 基础分析 原始数据质控检查 比对结果质控检查 RNA种类分析统计 miRNA表达分析 基于miRNA表达的样品主成分分析 miRNA差异分析 差异 miRNA 靶基因预测 差异 miRNA 靶基因的GO功能分析 差异 miRNA 靶基因的KEGG通路分析 差异 miRNA 靶基因的Rectome通路分析 高级分析 差异miRNA与差异表达基因调控分析 差异miRNA与差异表达基因网络绘图 Table1. 外泌体测序原始样本送样建议
Table2. 外泌体测序样本送样建议
*更具体的送样方法请详询销售或技术支持 物种范围:人、小鼠、大鼠等哺乳动物,拟南芥、水稻、番茄、玉米、大豆等植物,其他物种详询销售或技术支持 Q1:外泌体全转录组测序,提取出来的RNA有100~200ng。是采用微量建库的方法建库,还是常规建库方法建库呢? A1:如果提取出来的RNA量超过100ng,建议采用常规去rRNA链特异方法,用100ngRNA进行全转录组建库。相对来说,建库input的模板量越大,基因信息的覆盖度越高。微量建库方法是在样本量较少的情况下采用的建库方法,在可以的情况下,尽量采用常规建库方法进行实验。
Q2:外泌体研究,应选用血浆还是血清? A2:血清是血液凝固之后收集的液体,其中少了纤维蛋白原,凝血因子,以及多了很多凝血产物。纤维蛋白原可转化为纤维蛋白,具有凝血功能。在凝血过程中血小板会分泌大量的外泌体,有研究发现血清中有接近50%的外泌体来自额外的分泌。 血浆=血液-血细胞 血清=血浆-纤维蛋白原-凝血因子 所以一般实验选择血浆,在特殊情况下,如研究与血小板相关的疾病的时候,血清更适合。 |