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微生物宏基因组测序 | Metagenomics Sequencing
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常见问题

对微生物群体进行高通量测序,通过数据分析特定环境中微生物群体基因组成及功能,研究微生物多样性、种群结构、生物进化与环境之间的关系,解读微生物群体多样性与丰度,微生物与宿主之间的关系,发掘和研究新的、具有特定功能的基因,挖掘具有应用价值的基因资源,应用于开发新的微生物活性物质。

60 宏基因组.png

微生物宏基因组测序技术路线

测序方案
测序平台Illumina Novaseq 6000

测序模式PE150

测序数据量5-10 Gb raw data







生物信息分析

基础分析

物种组成和丰度统计

样品复杂度分析

样品间物种丰度差异分析

基因组组装

基因组组分分析

基因功能GO-COG注释

基因功能KOGKEGG注释


自定义分析

多样品显著相关因子分析

与疾病相关的基因的深度分析

菌群共生关系网络构建

系统进化树构建

Table1.宏基因组测序原始样本送样建议

送样类型

送样量

备注

粪便、土壤等环境样本

≥2g


Table2.宏基因组测序DNA样本送样建议

送样类型

送样量

浓度

纯度

DNA

≥4μg

≥30ng/μl

无蛋白/盐离子等污染

*更具体的送样方法请详询销售或技术支持

物种范围:常见有参微生物,详询销售或技术支持








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