circRNA qPCR引物设计circRNA qPCR检测全转录组测序 | RNA-seqcircRNA测序 | circRNA-seq外泌体RNA测序 | Exosome RNA-seq生物医学大数据挖掘circRNA qPCR引物设计合成(1)circRNA表达分析circRNA过表达实验circRNA干扰实验细胞功能实验慢病毒包装circRNA功能分析RNA m6A甲基化测序 | MeRIP-SeqcircRNA表观转录组T系列-circRNA翻译验证R系列-IRES活性检测核糖体印迹测序 | Ribo-seq核糖体-新生肽链复合物测序 | RNC-seqcircRNA翻译-验证研究circRNA注释及功能预测circRNA荧光素酶报告检测circRNA RIP实验circRNA pull-down实验circRNA FISH探针合成circRNA相互作用组学研究circRNA FISH探针合成circRNA定位分析circRNA全长纳米孔测序 | ONT circRNA full-length Sequencin三代测序全转录组测序 | RNA-seqcircRNA测序 | circRNA-seqmRNA测序 | mRNA-seq小RNA测序 | miRNA-seq转录组学研究核糖体印迹测序 | Ribo-seq核糖体-新生肽链复合物测序 | RNC-seq翻译组学研究RNA m6A甲基化测序 | MeRIP-Seq染色质开放性测序 | ATAC-seq表观组学研究10×Visium空间转录组测序空间转录组学研究外泌体RNA测序 | Exosome RNA-seq外泌体提取及鉴定外泌体研究RNA免疫共沉淀测序 | RIP-seq染色质免疫共沉淀测序 | ChIP-seq核酸蛋白互作研究微生物宏基因组测序 | Metagenomics Sequencing基因组学研究生物医学大数据挖掘分析circRNA定制化分析及绘图常规组学及多组学联合分析单细胞测序数据生信分析生物信息学分析服务(右边模板)科研服务RNase RcircRNA qRT-PCR试剂盒circRNA检测circRNA过表达系列circRNA过表达载体系列血液基因组DNA提取试剂盒全血RNA提取试剂盒细胞RNA提取试剂盒核酸提取与纯化RNA pull-down试剂盒RIP试剂盒T7转录试剂盒(生物素标记)分子互作系列外泌体提取试剂盒Taqman探针法支原体检测试剂盒(UNG防污染版)支原体检测核糖体RNA去除试剂盒(人/大鼠/小鼠)核糖体RNA去除试剂盒(植物)RNA-seq文库构建试剂盒RNA建库接头试剂DNA磁珠RNA磁珠高通量测序系列circRNA标准品系列CircLucT7耐高温高产量RNA合成试剂盒环状RNA合成试剂盒T4 RNA连接酶1T4 RNA连接酶2circRNA制备系列(右边模板)产品中心
生物医学大数据挖掘分析
产品介绍
案例解析
结果展示
送样建议
常见问题

随着高通量测序技术的迅猛发展,各种生物医学数据库应运而生,大数据挖掘技术已成为生物医学领域中最新最重要驱动力之一。GEO是当今最大、最全的公共基因数据资源库,包括基因的表达、突变、修饰等信息,涵盖几乎所有的疾病,且单个实验检测样品数目较多。TCGA数据库包含11,000个病人的33种肿瘤的7个不同层面的基因数据(包括基因表达、CNVSNPDNA甲基化,miRNA,外显子组等)和临床数据,旨在解析癌症发生的分子机制、肿瘤的亚型和治疗靶点等,也可佐证实验数据和提供新的研究思路,因此近年来基于GEOTCGA数据发表的文章指数级增长。


吉赛生物融合数据挖掘技术、生物信息学和医学统计学,挖掘公共数据库并提取有价值的信息,加速科研进度。








部分结果示例


图1. 公共数据挖掘思路及结果展示


1. 公共数据挖掘

根据客户需求,挖掘TCGAGEOSRA等公共数据库蕴含的多层面的疾病数据,提供差异筛选、功能富集、靶基因预测、网络分析、生存分析、分子标志物分析等多种生物信息学分析内容。


2. 免疫浸润分析

免疫浸润分析可在转录组表达水平反映各样本的免疫活性状况,揭示组织细胞的免疫微环境。肿瘤具有很强的异质性,同一肿瘤在不同个体之间具有不同的免疫活性,而具有相似免疫活性状况的样本则可能处于相同的免疫微环境,免疫浸润分析是肿瘤微环境分析的强有力手段。


3. 预后分子分型

通过分析癌症等疾病样本中的基因信息(表达、甲基化等)以及临床信息,使用多种分类器挖掘预后相关标志物,为疾病的预后提供有效的预测模型。


4. 生物标记物分析

通过分析癌症等疾病和正常样本的基因信息(表达、甲基化等),使用分子建模的方法,发现早期诊断标志物。













地址:广州科学城掬泉路 3 号国际企业孵化器 D 区 706-707

版权所有: 广州吉赛生物科技股份有限公司    Copyright 2014 All Rights

备案号:粤ICP备16055576号-1