circRNA技术服务
高通量测序服务
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通过超声或酶处理将染色质随机切割,利用抗原抗体的特异性识别反应,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来,再通过反交联释放结合蛋白的DNA片段,最后对目的DNA片断进行纯化与文库构建,通过高通量测序的方法获得蛋白质与DNA相互作用的信息。 染色质免疫共沉淀测序技术路线
测序方案 测序模式:PE150 测序数据量:10 Gb raw data 生物信息分析 基础分析 测序数据质量评估(碱基质量评估、序列质量评估) 比对结果质控检查 测序reads全基因组分布图 结合峰peak鉴定 结合峰基因元件分布可视化 富集peak的motif分析
高级分析(有不同处理条件分组样本) 差异结合峰检测分析 差异结合峰相关基因GO功能富集分析 差异结合峰相关基因KEGG生物通路富集分析 差异结合峰相关基因Reactome通路分析
部分结果示例 图1. peak 在转录起始位点上下游 3kb 的平均覆盖度 图2. peak 在染色体上的分布图 图3. De novo motif 分析结果 Table1.ChIP-seq DNA样本送样建议
*更具体的送样方法请详询销售或技术支持 物种范围:人、小鼠、大鼠,其他物种请详询销售或技术支持 |