circRNA qPCR引物设计circRNA qPCR检测circRNA表达分析circRNA过表达实验circRNA干扰实验细胞功能实验慢病毒包装circRNA功能分析T系列-circRNA翻译验证R系列-IRES活性检测circRNA翻译-验证研究circRNA注释及功能预测circRNA荧光素酶报告检测circRNA RIP实验circRNA pull-down实验circRNA相互作用组学研究circRNA FISH探针合成circRNA定位分析circRNA全长纳米孔测序 | ONT circRNA full-length Sequencin三代测序全转录组测序 | RNA-seqcircRNA测序 | circRNA-seqmRNA测序 | mRNA-seq小RNA测序 | miRNA-seq转录组学研究核糖体印迹测序 | Ribo-seq核糖体-新生肽链复合物测序 | RNC-seq翻译组学研究RNA m6A甲基化测序 | MeRIP-Seq染色质开放性测序 | ATAC-seq表观组学研究10×Visium空间转录组测序空间转录组学研究外泌体RNA测序 | Exosome RNA-seq外泌体提取及鉴定外泌体研究RNA免疫共沉淀测序 | RIP-seq染色质免疫共沉淀测序 | ChIP-seq核酸蛋白互作研究微生物宏基因组测序 | Metagenomics Sequencing基因组学研究生物医学大数据挖掘分析circRNA定制化分析及绘图常规组学及多组学联合分析单细胞测序数据生信分析生物信息学分析服务RNase RcircRNA qRT-PCR试剂盒circRNA检测circRNA过表达系列circRNA过表达载体系列血液基因组DNA提取试剂盒全血RNA提取试剂盒细胞RNA提取试剂盒核酸提取与纯化RNA pull-down试剂盒RIP试剂盒T7转录试剂盒(生物素标记)分子互作系列外泌体提取试剂盒Taqman探针法支原体检测试剂盒(UNG防污染版)支原体检测核糖体RNA去除试剂盒(人/大鼠/小鼠)核糖体RNA去除试剂盒(植物)RNA-seq文库构建试剂盒RNA建库接头试剂DNA磁珠RNA磁珠高通量测序系列circRNA标准品系列CircLucT7耐高温高产量RNA合成试剂盒环状RNA合成试剂盒T4 RNA连接酶1T4 RNA连接酶2circRNA制备系列原位杂交系列原位杂交系列
染色质免疫共沉淀测序技术 | ChIP-seq
产品介绍
案例解析
结果展示
送样建议
常见问题

通过超声或酶处理将染色质随机切割,利用抗原抗体的特异性识别反应,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来,再通过反交联释放结合蛋白的DNA片段,最后对目的DNA片断进行纯化与文库构建,通过高通量测序的方法获得蛋白质与DNA相互作用的信息。

56 ChIP测序.png

染色质免疫共沉淀测序技术路线

测序方案
测序平台Illumina Novaseq 6000

测序模式PE150

测序数据量10 Gb raw data


生物信息分析

基础分析

测序数据质量评估(碱基质量评估、序列质量评估)

比对结果质控检查

测序reads全基因组分布图

结合峰peak鉴定

结合峰基因元件分布可视化

富集peakmotif分析


高级分析(有不同处理条件分组样本)

差异结合峰检测分析

差异结合峰相关基因GO功能富集分析

差异结合峰相关基因KEGG生物通路富集分析

差异结合峰相关基因Reactome通路分析


部分结果示例


图片1.png

图1. peak 在转录起始位点上下游 3kb 的平均覆盖度


2. peak 在染色体上的分布图


3. De novo motif 分析结果



Table1.ChIP-seq DNA样本送样建议

送样类型

送样量

浓度

纯度

ChIP DNA/ChIRP DNA

≥20ng

≥0.2ng/μl

无蛋白污染

*更具体的送样方法请详询销售或技术支持

物种范围:人、小鼠、大鼠,其他物种请详询销售或技术支持








地址:广州科学城掬泉路 3 号国际企业孵化器 D 区 706-707

版权所有: 广州吉赛生物科技股份有限公司    Copyright 2014 All Rights

备案号:粤ICP备16055576号-1