circRNA qPCR引物设计circRNA qPCR检测circRNA表达分析circRNA过表达实验circRNA干扰实验细胞功能实验慢病毒包装circRNA功能分析T系列-circRNA翻译验证R系列-IRES活性检测circRNA翻译-验证研究circRNA注释及功能预测circRNA荧光素酶报告检测circRNA RIP实验circRNA pull-down实验circRNA相互作用组学研究circRNA FISH探针合成circRNA定位分析circRNA全长纳米孔测序 | ONT circRNA full-length Sequencin三代测序全转录组测序 | RNA-seqcircRNA测序 | circRNA-seqmRNA测序 | mRNA-seq小RNA测序 | miRNA-seq转录组学研究核糖体印迹测序 | Ribo-seq核糖体-新生肽链复合物测序 | RNC-seq翻译组学研究RNA m6A甲基化测序 | MeRIP-Seq染色质开放性测序 | ATAC-seq表观组学研究10×Visium空间转录组测序空间转录组学研究外泌体RNA测序 | Exosome RNA-seq外泌体提取及鉴定外泌体研究RNA免疫共沉淀测序 | RIP-seq染色质免疫共沉淀测序 | ChIP-seq核酸蛋白互作研究微生物宏基因组测序 | Metagenomics Sequencing基因组学研究生物医学大数据挖掘分析circRNA定制化分析及绘图常规组学及多组学联合分析单细胞测序数据生信分析生物信息学分析服务RNase RcircRNA qRT-PCR试剂盒circRNA检测circRNA过表达系列circRNA过表达载体系列血液基因组DNA提取试剂盒全血RNA提取试剂盒细胞RNA提取试剂盒核酸提取与纯化RNA pull-down试剂盒RIP试剂盒T7转录试剂盒(生物素标记)分子互作系列外泌体提取试剂盒Taqman探针法支原体检测试剂盒(UNG防污染版)支原体检测核糖体RNA去除试剂盒(人/大鼠/小鼠)核糖体RNA去除试剂盒(植物)RNA-seq文库构建试剂盒RNA建库接头试剂DNA磁珠RNA磁珠高通量测序系列circRNA标准品系列CircLucT7耐高温高产量RNA合成试剂盒环状RNA合成试剂盒T4 RNA连接酶1T4 RNA连接酶2circRNA制备系列原位杂交系列原位杂交系列
circRNA过表达系列
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自2015年推出商业化circRNA过表达载体(国家授权发明专利:201510566302)以来,吉赛生物一直致力于circRNA过表达技术的改进和相关产品开发,持续优化现有的载体产品,circRNA过表达载体已全面升级为第五代。

第五代circRNA过表达载体现有pCD5-ciR、pCD25-ciR、pLO5-ciR、pLC5-ciR、pK5ssAAV-ciR和pK25ssAAV-ciR,能满足普通真核表达、慢病毒包装和腺相关病毒(AAV)包装等多种用途。载体均携带优化过的侧翼成环框架,含有精心改造的Alu元件、QKI等RBP的结合位点,并使用全新设计的环化介导序列,能保证插入的circRNA准确高效环化。


第五代circRNA过表达载体的主要特点

1.环化准确性更高。全新设计的成环框架和环化介导序列,在保证高效率过表达的前提下环化准确性更高,比上代载体准确环化成功率提高60%。

2.稳定性更高。对长度小于200 nt或大于2000 nt的circRNA准确高效过表达成功率更高,比上代载体成功率提高30%。

3.通用性更强。提升对非天然circRNA序列的支持,插入任意一段序列也可以准确高效成环,比上代载体成功率提高50%。

4.可移植性更高。6个载体全部预留最常用的EcoRI和BamHI酶切位点,不同载体间转换更方便。


产品信息

名称货号规格目录价(元)存温度
真核过表达载体GENESEED®pCD5-ciRGS010510μg质粒+200μL菌液30004℃
真核过表达载体GENESEED®pCD25-ciR(GFP)
GS0106
3000
慢病毒过表达载体GENESEED®pLO5-ciRGS01073000
慢病毒过表达载体GENESEED®pLC5-ciR(GFP)
GS01083000
AAV过表达载体GENESEED®pK5ssAAV-ciR
GS01093000
AAV过表达载体GENESEED®pK25ssAAV-ciR(GFP)GS01103000





无GFPGFP
真核表达载体GENESEED®pCD5-ciRGENESEED®pCD25-ciR只瞬时表达
慢病毒表达载体GENESEED®pLO5-ciRGENESEED®pLC5-ciR
可稳定/瞬时表达
AAV表达载体GENESEED®pK5ssAAV-ciRGENESEED®pK25ssAAV-ciR可稳定/瞬时表达



吉赛推出了升级的第五代circRNA过表达载体,有pCD5-ciR、pCD25-ciR、pLO5-ciR、pLC5-ciR、pK5ssAAV-ciR和pK25ssAAV-ciR,使用时只需要克隆circRNA的序列(线性化)进载体中,和常规的载体构建一模一样,相对简便省事。能满足普通真核表达、慢病毒包装和腺相关病毒(AAV)包装等多种用途,优点有环化准确性更高、稳定性更高、通用性更强和可移植性更高。


案例1

2020年9月14日,中山大学孙逸仙纪念医院苏士成教授合作团队在Cell杂志(IF 41.584)上发表了题为Targeting Mitochondria-Located circRNA SCAR Alleviates NASH via Reducing mROS Output的文章,文章应用Arraystar Human CircRNA芯片筛选鉴定出与非酒精性脂肪性肝炎发生相关的环状RNA分子SCAR,并发现在线粒体中过表达circRNA SCAR能够抑制肝脏成纤维细胞的活化相应的炎症反应,敲低则有相反的表型。并且作者使用吉赛公司过表达载体 pcD-ciR 通过插入3×flag标签以及预测的ORF序列(图1),发现circRNA SCAR无法编码蛋白质,随后作者通过一系列实验发现该circRNA能够直接与ATP5B结合并发挥生物学功能[1]。作者团队发现了线粒体circRNA的重要功能并发展了一系列相关的实验方法,为免疫代谢疾病提供了一种有吸引力的治疗策略。

案例2

南京医科大学王美林教授,杜牧龙副教授和刘凌翔主任医师共同通讯在Molecular Cancer杂志在线发表文章Exosomal circLPAR1 functions in colorectal cancer diagnosis and tumorigenesis through suppressing BRD4 via METTL3–eIF3h interaction,本研究强调了血浆外泌体中的circLPAR1在结直肠癌诊断中是一个有前途的预测因子,并描述了其对结直肠癌发生的生物学调节。为临床早期诊断和疾病发展的发病机制研究提供了新的视角。


2使用 MS2 标记系统的 circLPAR1 下拉实验

本研究中,作者使用circRNA pull-down技术进行circRNA下拉试验,进而对下拉蛋白产物进行质谱分析。CircRNA pull-down技术是使用带有MS2捕获蛋白(MS2-CP)的circRNA下拉分析来确定与circLPAR1相关的RNA结合蛋白(RBPs)。如图2所示,该技术是在吉赛生物专利技术circRNA过表达载体基础上,将RNA标签体系引入circRNA中,通过RNA标签和捕获蛋白的高度特异且稳定相互作用,进行靶分子捕获和相互作用分子的捕获。


案例解析参考文献:

Qiyi Zhao, Jiayu Liu, Hong Deng, et al. Targeting Mitochondria-Located circRNA SCAR Alleviates NASH via Reducing mROS Output.Cell (2020), https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.08.009


Shanyue Tan, et al. Exosomal circLPAR1 functions in colorectal cancer diagnosis and tumorigenesis through suppressing BRD4 via METTL3–eIF3h interaction   Mol Cancer.(
2022); doi:
10.1186/s12943-021-01471-y



1、Qiyi Zhao, Jiayu Liu, Hong Deng, et al. Targeting Mitochondria-Located circRNA SCAR Alleviates NASH via Reducing mROS Output.Cell (2020), https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.08.009


2、Rui Zheng,#1,2 Ke Zhang,#3 Shanyue Tan, et al. Exosomal circLPAR1 functions in colorectal cancer diagnosis and tumorigenesis through suppressing BRD4 via METTL3–eIF3h interaction   Mol Cancer.( 2022); doi: 10.1186/s12943-021-01471-y


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1、circRNA过表达怎么做?

CircRNA的形成和线性RNA不同,因此对circRNA的过表达不能直接将序列连接到常规的真核表达载体(如pcDNA3.1)来进行。已明确的circRNA形成依赖于侧翼序列中的反向互补序列(RCMs,如Alu元件)或与能调控circRNA生成的蛋白(如QKI)的结合位点,因此构建载体时可以在circRNA序列上下游分别增加一段反向互补的序列,质粒转染细胞后会先转录出上游+circRNA+下游的线性RNA链,再依靠长下游的反向互补配对促使成环。


2、 circRNA过表达成功标准?

载体构建好后瞬时转染细胞进行RT-PCR检测以验证过表达效率。

1)qPCR检测有过表达倍数,质粒瞬转效率高,基因本底丰度不太高的话一般都可以过表达50倍以上;

2)使用Divergent引物检测过表达的PCR产物是大小正确的单一条带,PCR产物进行sanger测序确定成环序列准确。满足这两个条件才可以认为载体实现了对circRNA的准确高效率过表达。


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