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技术前沿
circRNA研究汇总 | 20210531-20210606
来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2021-06-07 | 402 次浏览 | 分享到:

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计46篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

 

1、circSPARC通过调节JAK/STAT通路增强结直肠癌的迁移和增殖

标题:The circular RNA circSPARC enhances the migration and proliferation of colorectal cancer by regulating the JAK/STAT pathway

杂志:Mol Cancer. 影响因子:15.304

通讯作者:王人颢和宋军教授(徐州医科大学)

环状RNA(circRNA)等非编码RNA在人体内大量存在,影响着各种疾病的发生和发展。然而,circRNAs在结直肠癌(CRC)中的生物学功能在很大程度上是未知的。该研究方法上采用RT-qPCR检测CRC细胞和组织中circRNA和mRNA的表达。荧光原位杂交(FISH)用于分析circSPARC的位置。在体外和体内使用 circSPARC 敲低和过表达细胞系进行基于功能的实验,包括 CCK8、集落形成、transwell 和转移模型。在机制上,进行了荧光素酶报告基因测定、蛋白质印迹、RNA 免疫沉淀 (RIP)、ChIRP和免疫组织化学染色。结果表明:CircSPARC 在 CRC 患者的组织和血浆中均上调。 circSPARC 的高表达与晚期 TNM 分期、淋巴结转移和较差的存活率相关。沉默circSPARC在体外和体内抑制CRC细胞迁移和增殖。从机制上讲,circSPARC 吸附 miR-485-3p 以上调 JAK2 表达并最终促进磷酸化 (p)-STAT3 的积累。此外,circSPARC 招募了 FUS,这促进了 p-STAT3 的核易位。这些发现表明,circSPARC 可能通过调节 JAK2/STAT3 通路作为潜在的诊断和预后生物标志物以及 CRC 治疗的治疗靶点。

 

图注:circSPARC促进结肠癌进展示意图

 

 

2、在心脏移植中使用环状 RNA FSCN1 沉默的树突细胞预防同种免疫排斥

标题:Preventing alloimmune rejection using circular RNA FSCN1-silenced dendritic cells in heart transplantation

杂志:J Heart Lung Transplant.影响因子:7.866

通讯作者: 柳克祥(吉林大学第二医院)和Xiufen Zheng (加拿大韦仕敦大学)

虽然心脏移植心力衰竭的标准治疗方法,但移植排斥仍然是一个挑战。最近的证据表明,环状RNA(circRNA)是一种新型的细胞发育基因调控因子。我们的目的是证明用环状 RNA FSCN1 (circFSCN1) 沉默产生的耐受性树突细胞 (Tol-DCs) 治疗可以防止同种免疫排斥并延长心脏移植中心脏移植物的存活率。方法上我们采用体外circFSCN1 siRNA转染骨髓来源的DC。通过 qRT-PCR 测量 circFSCN1 水平。 流式细胞术测定DC成熟。混合淋巴细胞反应 (MLR) 评估 DC 激活 T 细胞和生成调节性 T 细胞 (Treg) 的功能。原位 RNA 杂交和荧光显微镜检查检测 circFSCN1 在 DC 中的分布。异位同种异体小鼠心脏移植,其中受用供体衍生的 circFSCN1 沉默的 Tol-DC 进行预处理监测心跳以评估免疫排斥。结果显示:

 circFSCN1 在成熟 DCs 的细胞质中高表达。使用 siRNA 敲circFSCN1 会阻止处于未成熟状态的 DC,削弱 DC 激活 T 细胞的能力并增强 Treg 生成。用 circFSCN1 沉默的 Tol-DCs 治疗可防止同种免疫排斥、延长同种异体移植物存活、减少纤维化并在体内诱导 Tregs。circFSCN1 的敲低诱导 Tol-DCs,用这些 Tol-DCs 治疗可防止同种免疫排斥并延长同种异体移植物的存活。这是一个很有前景的治疗靶点,可以对抗心脏移植中的移植排斥,并增加我们对免疫系统中 circRNA 的理解。

图注:circFSCN1 沉默的树突细胞预防心脏移植的同种免疫排斥作用示意图

 

3、基于组学方法的微囊藻毒素毒理学研究进展

标题:Advances in the toxicology research of microcystins based on Omics approaches

杂志:Environ Int. 影响因子:7.578

通讯作者:张慧珍教授(郑州大学公共卫生学院)

微囊藻毒素(MCs)是分布最广的蓝藻毒素,可以通过多种方式被动物和人体摄入,对人类健康和野生动物的生物多样性构成威胁。因此,对MCs的毒性作用及其机制的研究是人们关注的焦点之一。近年来,组学技术,即基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学,为全面理解和揭示MCs毒性的分子机制做出了重要贡献。本文主要通过组学方法对现有文献进行综述,探讨MCs在多个物种的肝、性腺、脾、脑、肠和肺中的毒性机制。研究发现,MCs在蛋白质、转录和代谢水平上对细胞周期、细胞凋亡、细胞骨架破坏和氧化还原紊乱的各种代谢活动和细胞信号转导产生强烈的毒性作用。同时,还揭示了非编码RNAmiRNAcircRNAlncRNA等)和肠道微生物群的改变在MCs的毒性作用中起着重要的调节作用,尤其是在肝毒性和生殖毒性方面。此外,我们总结了当前的研究空白并指出了未来的研究方向。本文的详细信息表明,组学技术的应用和发展极大地促进了MCs毒性的研究,也是探索MCs毒性机制的宝贵资源。

 

参考文献:

序号

主要内容

论文标题

杂志

影响因子

单位

1

circSPARC通过调节JAK/STAT通路增强结直肠癌的迁移和增殖

The circular RNA circSPARC enhances the migration and proliferation of colorectal cancer by regulating the JAK/STAT pathway

Mol Cancer.

15.304

徐州医科大学等

2

在心脏移植中使用环状 RNA FSCN1 沉默的树突细胞预防同种免疫排斥

Preventing alloimmune rejection using circular RNA FSCN1-silenced dendritic cells in heart transplantation

J Heart Lung Transplant.

7.866

吉林大学第二医院等

3

基于组学方法的微囊藻毒素毒理学研究进展

Advances in the toxicology research of microcystins based on Omics approaches

Environ Int.Review

7.578

郑州大学等

4

HNRNPM 控制 circRNA 生物发生和剪接保真度以维持癌细胞健康

HNRNPM controls circRNA biogenesis and splicing fidelity to sustain cancer cell fitness

Elife.

7.08

美国西奈山伊坎医学院等

5

转录组分析表明,硫化氢暴露通过 ciR-PTPN23/miR-15a/E2F3 信号在肉鸡胸腺中抑制细胞增殖并诱导细胞凋亡

Transcriptome analysis reveals that hydrogen sulfide exposure suppresses cell proliferation and induces apoptosis through ciR-PTPN23/miR-15a/E2F3 signaling in broiler thymus

Environ Pollut.

6.791

东北农业大学等

6

GATCDA:基于图注意力网络预测circRNA-疾病关联

GATCDA: Predicting circRNA-Disease Associations Based on Graph Attention Network

Cancers (Basel).

6.126

萨斯喀彻温大学等

7

非编码基因的全谱分析和竞争内源性RNA 网络分析来自糖尿病、老年和年轻患者的脂肪干细胞中的 RNA

The whole profiling and competing endogenous RNA network analyses of noncoding RNAs in adipose-derived stem cells from diabetic, old, and young patients

Stem Cell Res Ther.

5.116

武汉协和医院等

8

一项全面的 RNA 研究以确定乳腺癌中多西紫杉醇耐药的 circRNA  miRNA 生物标志物

A Comprehensive RNA Study to Identify circRNA and miRNA Biomarkers for Docetaxel Resistance in Breast Cancer

Front Oncol.

4.849

丹麦哥本哈根大学等

9

肝细胞癌中的环状 RNA:临床意义的新兴功能

Circular RNAs in Hepatocellular Carcinoma: Emerging Functions to Clinical Significances

Front Oncol.Review

4.849

吉林大学中日联谊医院等

10

针对非编码 RNA 的治疗在预防和限制心肌梗塞及随后的心脏重构中的作用-当前的经验和展望

Therapies Targeted at Non-Coding RNAs in Prevention and Limitation of Myocardial Infarction and Subsequent Cardiac Remodeling-Current Experience and Perspectives

Int J Mol Sci.Review

4.559

波兰华沙医科大学等

11

经典和内部环状 RNA 在银屑病皮肤中作为竞争性内源性 RNA 起作用

Canonical and Interior Circular RNAs Function as Competing Endogenous RNAs in Psoriatic Skin

Int J Mol Sci.

4.559

华盛顿大学医学院等

12

非编码 RNA 在双相情感障碍病理生理学中的作用的综合评价

A Comprehensive Review on the Role of Non-Coding RNAs in the Pathophysiology of Bipolar Disorder

Int J Mol Sci.Review

4.557

德黑兰医科大学等

13

4-壬基酚诱导的支持细胞损伤中竞争性内源性 RNA  RNA 谱和调控网络的鉴定

Identification of Competing Endogenous RNA and Micro-RNA Profiles and Regulatory Networks in 4-Nonylphenol-induced Impairment of Sertoli Cells

Front Pharmacol.

4.227

上海交通大学Bio-X研究院等

14

circRNA circ_0006677通过吸附miR-578和调节SOCS2表达抑制非小细胞肺癌的进展和糖酵解

CircRNA circ_0006677 Inhibits the Progression and Glycolysis in Non-Small-Cell Lung Cancer by Sponging miR-578 and Regulating SOCS2 Expression

Front Pharmacol.

4.227

厦门大学附属中山医院等

15

circRNA circ_0001666的沉默通过上调miR-1251和下调SOX4抑制胰腺癌中的EMT

Silencing of circRNA circ_0001666 Represses EMT in Pancreatic Cancer Through Upregulating miR-1251 and Downregulating SOX4

Front Mol Biosci.

4.186

上海市肺科医院等

16

癌症相关的 circRNA-miRNA-mRNA 调控网络:元分析

Cancer-Associated circRNA-miRNA-mRNA Regulatory Networks: A Meta-Analysis

Front Mol Biosci.

4.186

印度科学理工学院等

17

重新评估 Columnea 潜伏类病毒 (CLVd) 分类学分类

Reassessment of the Columnea latent viroid (CLVd) Taxonomic Classification

Microorganisms.

4.153

比利时(ILVO)等

18

环状RNAmmu_circ_0000296,通过miR-194-5p/Runx3/Sirt1轴对慢性脑缺血神经元凋亡的影响

Effect of circular RNA, mmu_circ_0000296, on neuronal apoptosis in chronic cerebral ischaemia via the miR-194-5p/Runx3/Sirt1 axis

Cell Death Discov.

4.11

辽宁省临床医学研究中心

19

外泌体circ-BRWD1通过调节miR-1277/TRAF6轴促进骨关节炎的发展

Exosomal circ-BRWD1 contributes to osteoarthritis development through the modulation of miR-1277/TRAF6 axis

Arthritis Res Ther.

4.104

山西医科大学第二医院等

20

CircHYBID 通过 hsa-miR-29b-3p/TGF-β1 轴调节软骨细胞的乙酰透明质酸代谢

CircHYBID regulates hyaluronan metabolism in chondrocytes via hsa-miR-29b-3p/TGF-β1 axis

Mol Med.

4.096

梅州市人民医院等

21

circRNA-miRNA-mRNA相关ceRNA网络的重建揭示了脑出血中的功能性circRNA

Reconstruction of circRNA-miRNA-mRNA associated ceRNA networks reveal functional circRNAs in intracerebral hemorrhage

Sci Rep.

3.995

哈尔滨医科大学等

22

CircSPAG16通过诱骗PIP5K1α灭活Akt来抑制镉诱导的人支气管上皮细胞转化

CircSPAG16 suppresses cadmium-induced transformation of human bronchial epithelial cells by decoying PIP5K1伪 to inactivate Akt

Mol Carcinog.

3.828

武汉同济医院等

23

Sp1介导的circRNA circHipk2通过靶向核糖体蛋白Rpl7调节肌生成

Sp1-Mediated circRNA circHipk2 Regulates Myogenesis by Targeting Ribosomal Protein Rpl7

Genes (Basel).

3.759

华南农业大学

24

circRNA 参与促炎细胞因子介导的 β 细胞功能障碍

Involvement of circRNAs in Proinflammatory Cytokines-Mediated 尾-Cell Dysfunction

Mediators Inflamm.

3.758

中南大学湘雅二医院等

25

Circ_CARM1 通过在抗苯并[a]-反式-7,8-二氢二醇-9,10-环氧化物转化的16HBE细胞中调节CTNNBIP1来控制细胞迁移

The Circ_CARM1 controls cell migration by regulating CTNNBIP1 in anti-benzo[a]pyrene-trans-7,8-dihydrodiol-9,10-epoxide-transformed 16HBE cells

Toxicol Lett.

3.567

广州医科大学等

26

Circ_0021087 通过吸附 miR-184 和提高 FOSB 表达抑制胃癌进展

Circ_0021087 acts as a miR-184 sponge and represses gastric cancer progression by adsorbing miR-184 and elevating FOSB expression

Eur J Clin Invest.

3.484

驻马店市中心医院等

27

Circ-ACAP2通过介导miR-143-3p/FZD4轴促进结直肠癌的进展

Circ-ACAP2 facilitates the progression of colorectal cancer through mediating miR-143-3p/FZD4 axis

Eur J Clin Invest.

3.483

福建省立医院等

28

circNSUN2通过miR-181a-5p/ROCK2轴促进结直肠癌细胞恶性生物学行为

circNSUN2 promotes the malignant biological behavior of colorectal cancer cells via themiR-181a-5p/ROCK2 axis

Oncol Rep.

3.417

昆明医科大学第一附属医院等

29

circRNA-miRNA-mRNA调控网络的构建揭示了骨肉瘤的潜在机制和治疗选择

Construction of a circRNA-miRNA-mRNA Regulatory Network Reveals Potential Mechanism and Treatment Options for Osteosarcoma

Front Genet.

3.255

武汉同济医院等

30

circHIPK3 通过吸附miR-561  miR-192 激活巨噬细胞 NLRP3 炎症小体和 TLR4 通路在痛风性关节炎中

Circular RNA circHIPK3 Activates Macrophage NLRP3 Inflammasome and TLR4 Pathway in Gouty Arthritis via Sponging miR-561 and miR-192

Inflammation.

3.213

郑州大学第一附属医院等

31

心力衰竭潜在遗传生物标志物的探索:系统评价

Exploration of Potential Genetic Biomarkers for Heart Failure: A Systematic Review

Int J Environ Res Public Health.Review

2.847

香港中文大学等

32

Circ-PNPT1 通过 miR-889-3p/PAK1 轴调节滋养层细胞的功能,从而导致妊娠期糖尿病(GDM

Circ-PNPT1 contributes to gestational diabetes mellitus (GDM) by regulating the function of trophoblast cells through miR-889-3p/PAK1 axis

Diabetol Metab Syndr.

2.708

湖北省妇幼保健院等

33

环状RNA在舌鳞状细胞癌中的表达谱及生物信息学分析

Expression profile and bioinformatics analysis of circular RNAs in tongue squamous cell carcinoma

Oral Dis.

2.612

福建医科大学口腔医学院等

34

环状RNA在糖尿病中的多种新功能

Multiple novel functions of circular RNAs in diabetes mellitus

Arch Physiol Biochem.

2.576

伊朗医学科学大学

35

猪乳源性小细胞外囊泡通过 pIgR 促进肠道免疫球蛋白的产生

Porcine Milk-Derived Small Extracellular Vesicles Promote Intestinal Immunoglobulin Production through pIgR

Animals (Basel).

2.321

华南农业大学等

36

山羊(Capra hircus)棕色到白色脂肪组织转化过程中环状 RNA 的动态表达谱

Dynamic Expression Profiles of Circular RNAs during Brown to White Adipose Tissue Transformation in Goats (Capra hircus)

Animals (Basel).

2.321

四川农业大学等

37

环状RNA 0102049通过调节miR-520g-3p/PLK2轴抑制骨肉瘤的进展

Circular RNA 0102049 suppresses the progression of osteosarcoma through modulating miR-520g-3p/PLK2 axis

Bioengineered.

2.209

南方医科大学珠江医院等

38

环状RNA circ_0001162通过miR-936/ERBB4轴促进胶质瘤细胞增殖和侵袭

Circular RNA circ_0001162 promotes cell proliferation and invasion of glioma via the miR-936/ERBB4 axis

Bioengineered.

2.209

广东省人民医院等

39

环状RNA circ_0003028在非小细胞肺癌中通过miR-1298-5p调控GOT2促进肿瘤发生

Circular RNA circ_0003028 contributes to tumorigenesis by regulating GOT2 via miR-1298-5p in non-small cell lung cancer

Bioengineered.

2.206

南通大学附属建湖医院等

40

circSAMD4A通过 miR-29-c-3p介导的AMPK/mTOR通路参与帕金森病多巴胺能神经元的凋亡和自噬

circSAMD4A participates in the apoptosis and autophagy of dopaminergic neurons via the miR-29-c-3p mediated AMPK/mTOR pathway in Parkinson's disease

Mol Med Rep.

2.104

宁波市第六医院等

41

环状RNA在乳腺癌中的新兴作用

Emerging role of circular RNAs in breast cancer

Pathol Res Pract.Review

2.051

伊朗德黑兰  医科大学等

42

小檗碱对人胃癌细胞环状 RNA 表达谱的影响

Effects of Berberine on Circular RNA Expression Profiles in Human Gastric Cancer Cells

Evid Based Complement Alternat Med.

1.814

上海市中医医院等

43

Hsa_circ_0031787促进结直肠癌细胞增殖和侵袭

Hsa_circ_0031787 promotes cell proliferation and invasion in colorectal cancer

J Clin Lab Anal.

1.542

湖南省中医药研究院附属医院等

44

Circ_0091702 通过调节 miR-182/PDE7A 轴在脓毒症中减轻脂多糖 (LPS) 诱导的细胞损伤

Circ_0091702 relieves lipopolysaccharide (LPS)-induced cell injury by regulating the miR-182/PDE7A axis in sepsis

Biosci Biotechnol Biochem.

1.515

河北医科大学第三医院等

45

环状RNA circ_0066147对胰腺癌进展的机制

Mechanisms of circular RNA circ_0066147 on pancreatic cancer progression

Open Life Sci.

0.691

芜湖市第二人民医院等

46

全转录组分析:对发情周期调节的影响

Whole Transcriptome Analysis: Implication to Estrous Cycle Regulation

Biology (Basel)

0

西北农林科技大学等