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  • 自2015年推出circRNA过表达载体(国家授权发明专利:201510566302)以来,吉赛生物持续优化不断开发,目前已将载体产品全面升级为第五代

     

    第五代circRNA过表达载体有pCD5-ciR、pCD25-ciR、pLO5-ciR、pLC5-ciR、pK5ssAAV-ciR和pK25ssAAV-ciR,能满足普通真核表达、慢病毒包装和腺相关病毒(AAV)包装等多种用途。载体均携带优化过的侧翼成环框架,含有精心改造的Alu元件、QKI等RBP的结合位点,并使用全新设计的环化介导序列,使插入的circRNA准确高效环化。




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    过表达载体图谱


    技术优势

    1. 过表达效率高:显著过表达50倍以上,最高可达上万倍;

    2. 序列环化准确:有效保证目标circRNA的线性序列准确环化,无碱基添加或缺失;

    3. 稳定性高:200nt~2000nt序列均能实现准确高效过表达;

    4. 适用范围广:可用于细胞瞬时转染、包装慢病毒或腺相关病毒,同时可提供GFP绿色荧光蛋白标记和嘌呤霉素抗性基因标记,适用不同实验需求。

     

    项目明细

    1. 载体构建;

    2. 瞬时转染(人293T细胞验证);

    3. 引物设计合成;

    4. qPCR验证(三次重复含内参);

    5. Sanger测序验证。

     

    客户提供

    1. circRNA名称(ID)、长度、序列、物种;

    2. 指定载体名称。

     

    交付标准

    1. 过表达质粒:10 μg质粒+200 μL甘油菌;

    2. 对照质粒:10 μg质粒+200 μL甘油菌;

    3. 载体构建与验证实验报告:

    ①载体构建步骤;

    ②载体测序验证结果原始文件;

    ③细胞转染实验步骤;

    ④qPCR检测原始数据及qPCR产物测序原始文件;

    ⑤qPCR检测实验步骤;

    ⑥载体构建与验证实验报告。





  • 2020年9月14日,中山大学孙逸仙纪念医院苏士成教授合作团队在Cell杂志IF 41.584)上发表了题为Targeting Mitochondria-Located circRNA SCAR Alleviates NASH via Reducing mROS Output文章,该文章应用Arraystar Human CircRNA芯片筛选鉴定出与非酒精性脂肪性肝炎发生相关的环状RNA分子SCAR,并发现线粒体中过表达circRNA SCAR能够抑制肝脏成纤维细胞的活化相应的炎症反应,敲低则有相反的表型。并且作者使用吉赛公司过表达载体 pcD-ciR 通过插入3×flag标签以及预测的ORF序列图1),发现circRNA SCAR无法编码蛋白质后作者通过一系列实验发现该circRNA能够直接与ATP5B结合发挥生物学功能[1]作者团队发现了线粒体circRNA的重要功能并发展了一系列相关的实验方法,为免疫代谢疾病提供了一种有吸引力的治疗策略。

    参考文献:

    Qiyi Zhao, Jiayu Liu, Hong Deng, et al. Targeting Mitochondria-Located circRNA SCAR Alleviates NASH via Reducing mROS Output.Cell (2020), https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.08.009




  • qRT-PCR检测

    图1 hsa_circ_00AAAAA的相对表达差异



    表1 hsa_circ_00AAAAA的相对表达



    qPCR产物测序结果:


    注:hsa_circ_00AAAAA在circBase中的环化位点序列GATTATGGAAACAGCTTTTTATAACTATGATG


    结论:

    相比于对照组,CAAAAA组的过表达倍数为***;PCR产物测序峰图正常,无杂峰或叠带,序列与环化位点参考序列对比吻合。以上结果表明CAAAAA能在真核细胞中成功过表达目的hsa_circ_00AAAAA



  • 1. circRNA过表达怎么做?

    CircRNA的形成和线性RNA不同,因此对circRNA的过表达不能直接将序列连接到常规的真核表达载体(如pcDNA3.1)来进行。已明确的circRNA形成依赖于侧翼序列中的反向互补序列(RCMs,如Alu元件)或与能调控circRNA生成的蛋白(如QKI)的结合位点,因此构建载体时可以在circRNA序列上下游分别增加一段反向互补的序列,质粒转染细胞后会先转录出上游+circRNA+下游的线性RNA链,再依靠长下游的反向互补配对促使成环。


    2. circRNA过表达成功标准?

    载体构建好后瞬时转染细胞进行RT-PCR检测以验证过表达效率。

    1)qPCR检测有过表达倍数,质粒瞬转效率高,基因本底丰度不太高的话一般都可以过表达50倍以上;

    2)使用Divergent引物检测过表达的PCR产物是大小正确的单一条带,PCR产物进行sanger测序确定成环序列准确。满足这两个条件才可以认为载体实现了对circRNA的准确高效率过表达。

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