合成生物学
circRNA整体研究解决方案
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  • IRES活性检测

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  • FAQ

  • 服务介绍


    circRNA的翻译模式分为IRES介导和m6A甲基化修饰介导,针对这些潜在的翻译方式,吉赛生物提供R系列载体构建和表达验证服务,验证circRNA的翻译是否由IRES介导。


    IRES验证载体示意图


    R1:Empty Vector(Luc2空载体)

    Luc2报告载体是基于海肾荧光素酶(Renilla Luciferase, R-Luc)和萤火虫荧光素酶(Firefly Luciferase, F-Luc)的cap-independent translation报告载体,R-Luc由5’ m7G帽子结构介导翻译起始,F-Luc只在插入有IRES(Internal Ribosome Entry Site)活性的序列或能介导翻译起始的序列时可以翻译。Luc2空载体含有多克隆酶切位点,命名为Luc2-IRES- Report。


    R2:EMCV IRES(插入EMCV IRES序列的Luc2报告载体阳性对照)

    Luc2阳性对照载体含有EMCV IRES序列,命名为Luc2-EMCV-IRES-Report。


    R3:IRES(插入预测IRES序列的Luc2报告载体)

    使用Luc2-IRES-Report载体进行构建,插入预测的IRES序列全长。


    R4:IRES-Del1(插入预测IRES前半部分序列的Luc2报告载体)

    使用Luc2-IRES-Report载体进行构建,插入部分预测的IRES序列(已删除后半部分)。


    R5:IRES-Del2 (插入预测IRES后半部分序列的Luc2报告载体)

    使用Luc2-IRES-Report载体进行构建,插入部分预测的IRES序列(已删除前半部分)。



    客户提供


    circRNA名称(ID)、物种&已预测的IRES序列信息及序列删减要求信息。



    我们提供

     

    1. R系列翻译Luc2-IRES-Report载体质粒(可选:R1-R5);

    2. 目的载体:10μg质粒+200μL甘油菌;

    3. 对照载体:10μg质粒+200μL甘油菌;

    4. Luc2-IRES-Report载体构建与验证实验报告:

    ① 载体构建步骤;

    ② 载体测序验证结果原始文件;

    ③ 细胞转染实验步骤;

    ④ 荧光素酶活性检测实验报告。



  • 案例展示:





    参考文献:

    Chen R, Yang T, Jin B, Xu W, Yan Y, Wood N, Lehmann HI, Wang S, Zhu X, Yuan W, Chen H, Liu Z, Li G, Bowen TS, Li J, Xiao J. CircTmeff1 Promotes Muscle Atrophy by Interacting with TDP-43 and Encoding A Novel TMEFF1-339aa Protein. Adv Sci (Weinh). 2023 Jun;10(17):e2206732. doi: 10.1002/advs.202206732. Epub 2023 Apr 23. PMID: 37088818; PMCID: PMC10265041.




  • 过表达载体构建及鉴定

    PCR扩增hsa_circ_00AAAA IRES全长***bp序列,以BamHI,EcoRI双酶切连接到Luc2-IRES-Report中。


    1   Luc2-IRES-Report载体图谱


    载体测序引物:Luc-seqF: CAGGAGGACGCTCCAGATGA

     

    测序峰图正常,无杂峰或叠带,序列对比吻合,表明IRES目的序列成功插入Luc2-IRES-Report中,载体构建成功。




  • R系列载体活性检测原理简介:

    报告载体质粒转染细胞,检测 F-Luc和R-Luc活性,以F-Luc/R-Luc的值判断序列的IRES活性。




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