服务介绍
为了方便研究工作,吉赛生物生信部联合加拿大多伦多大学创建了专业的circBank数据库(网址:http://www.circbank.cn/),为circRNA研究者提供最全面的人类circRNA注释、circRNA-miRNA调控、翻译潜能预测、疾病突变位点、m6A修饰和circRNA结构可视化等信息。依托前期circRNA大数据积累,可协助客户完成circRNA测序数据重分析,ceRNA调控网络、RBP结合预测、翻译潜能和高级结构预测等个性化定制生信服务。
circBank数据库包含以下几方面功能:
1. circRNA基因全新命名
2. circRNA基因基本特征注释信息
3. circRNA序列检索提取功能
4. circRNA结合miRNA预测
5. circRNA翻译蛋白潜能的预测评估
6. circRNA基因序列保守性分析结果
7. circRNA转录后修饰信息
circbank数据库
图1. circRNA-miRNA-mRNA调控网络图
图2. circRNA染色体分布图