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科研辟谣|Polysome Profiling不就是离心甩一甩？这4个真相你必须知道！
在中心法则的研究圈里，有一个技术虽然诞生于上世纪60年代，却依然被奉为翻译研究的“金标准”。它就是Polysome Profiling（多聚核糖体图谱分析）。
很多人对它的印象还停留在“古老”、“麻烦”甚至“没必要”上。今天，我们就用4个问答，带你重新认识这个能帮你“拿捏”高分文章的关键技术。
转录组测序这么发达，为什么还要做Polysome？
因为“听到的”不等于“做到的”。
转录组告诉你细胞“想”做什么（mRNA水平），而翻译组告诉你细胞“正在”做什么（蛋白合成水平）。
研究表明，转录组和蛋白组的变化往往不一致。特别是在以下场景中，Polysome Profiling是无可替代的：
应激反应（Stress）：缺氧、药物刺激时，细胞来不及转录新RNA，而是直接调控现有RNA的翻译效率。
病理机制（Pathology）：致病蛋白的过量表达，往往源于翻译起始的异常激活，而非转录增加。
只有通过Polysome Profiling计算翻译效率（TE），你才能解释为什么mRNA没变，蛋白却变了。
通过Polysome profiling计算TE[2]
这个技术原理是不是很复杂？
原理极其优雅简单——“以重取胜”。
想象mRNA是一条生产流水线，核糖体是工人在上面装配蛋白。
工效低：流水线上只有一个工人（单核糖体/80S），甚至没工人（游离RNA）。
工效高：流水线上挤满了工人（多聚核糖体/Polysome）。
根据“结合核糖体越多，复合物越重”的物理特性，利用蔗糖密度梯度超速离心，就能把它们分离开。通过分析RNA到底是在“单人区”还是“多人区”，就能精准判断基因的翻译活性。
Polysome profiling技术路线图[1]
听说这实验很简单，自己实验室就能做？
原理懂了，实操却是“劝退级”难度。
很多同学觉得：“不就是配个蔗糖溶液离心吗？”
错！但不全错。
这个实验的门槛在于“又大又细”：
设备门槛高：你需要大型超速离心机（连续转数小时）和专用的密度梯度分馏系统（含UV检测和流量泵），一般实验室很难配齐。
操作容错低：梯度溶液配置繁琐，且必须在裂解液中加入放线菌酮（CHX）“锁住”核糖体。一旦操作不当，多聚核糖体解聚，跑出来的图谱就是一堆杂乱的峰，数据直接报废。
既然这么难，有没有“开挂”的解决方案？
有！吉赛生物Polysome Profiling PLUS版。
为了解决传统实验分辨率低、操作难、数据粗的痛点，我们推出了升级版攻略，专治各种不服。
升级一：从“大概看”到“高清看”
传统方法可能只收3-5个组分。PLUS版根据沉降系数，将产物精细分离为18个组分！
好处：RT-qPCR的数据点更密集，折线图更平滑，能捕捉到翻译复合物极微小的迁移变化。
升级二：数据不仅要“全”，还要“准”
AUC统计：引入曲线下面积（AUC）分析，计算P/non-Pratio，用统计学数值量化样本的整体翻译活性。
严格质控：增加RNA完整性检测，根据质检结果调整上机量，确保下游测序不翻车。
升级三：打破样本“次元壁”
不仅能做细胞，连组织、细菌、真菌这种难搞的样本，PLUS版也能轻松搞定。
升级四：不仅仅是看编码基因
如果你在研究lncRNA或circRNA，PLUS版能帮你验证它们是否结合在多聚核糖体上。这是证明ncRNA具有翻译潜力（编码小肽）的硬核证据[3]！
小吉总结
如果你正苦恼于“有表型无机制”，或者“转录蛋白对不上”，千万别死磕RNA-seq了。
换个角度，从翻译组切入，利用Polysome Profiling PLUS拿到更精细的翻译效率数据，或许就是你文章冲刺高分的突破口！
Polysome profiling 扩展包
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参考资料
[1] Su D, et al. Ribosome profiling: a powerful tool in oncological research. Biomark Res. 2024, 12(1):11.
[2] Kovalski JR, et al. Functional screen identifies RBM42 as a mediator of oncogenic mRNA translation specificity. Nat Cell Biol. 2025 Mar;27(3):518-529.
[3] Wu X, et al. A novel protein encoded by circular SMO RNA is essential for Hedgehog signaling activation and glioblastoma tumorigenicity. Genome Biol. 2021;22(1):33.
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