Nature半年两连发:m¹Ψ让核糖体“慢下来”,ac⁴C如何实现“又快又准”?

发布时间:2026-09-23        浏览量:[ 38 ]

在基因表达研究中,mRNA水平与蛋白产出并不总是一致。即使转录本丰度相近,不同条件下的蛋白表达仍可能存在明显差异,其中,翻译过程是影响蛋白产出的重要环节。


翻译起始、核糖体延伸以及停滞和碰撞等过程,都会影响最终的蛋白合成效率。随着研究不断深入,越来越多工作开始关注核糖体在mRNA上的实际运行状态,翻译组学也成为研究基因表达调控的重要研究手段。


2026年,Nature先后发表两项关于合成mRNA翻译调控的研究,分别聚焦N¹-甲基假尿苷(m¹Ψ)和N⁴-乙酰胞苷(ac⁴C)。研究发现,不同RNA修饰会影响核糖体的翻译行为,并进一步影响翻译效率、核糖体碰撞以及蛋白产出。


从m¹Ψ到ac⁴C,两项研究都将关注点落在了一个问题上:RNA修饰之后,核糖体究竟发生了什么变化?


m¹Ψ重塑核糖体翻译动力学




【标      题】N¹-Methylpseudouridine directly modulates translation dynamics
【发表期刊】Nature
【发表日期】2026年1月14日
【研究团队】以色列魏茨曼科学研究所相关研究团队
【主要技术】Ribo-seq、RNA-seq、Polysome profiling、冷冻电镜

【IF】48.5


研究团队结合多种技术分析m¹Ψ修饰对合成mRNA翻译过程的影响。Ribo-seq结果显示,m¹Ψ修饰后,mRNA上的核糖体密度增加,并伴随更高的蛋白产出;Polysome profiling结果显示,修饰后的mRNA在不同核糖体负载组分中的分布发生变化。


m¹Ψ修饰对合成mRNA核糖体占位及多聚核糖体分布的影响[1]


对核糖体运行状态的进一步分析发现,m¹Ψ并非单纯提高翻译速度。在特定序列背景下,m¹Ψ会增加核糖体停留,使局部翻译延伸速度下降。Ribosome run-off实验进一步验证了这一延伸减慢现象。


m¹Ψ在特定序列背景下减慢核糖体翻译延伸[1]


为分析这一现象的结构基础,研究团队进一步开展冷冻电镜分析。结果显示,m¹Ψ会改变核糖体解码中心的局部相互作用,为翻译延伸减慢提供了结构层面的解释。


在此基础上,研究团队进一步分析翻译起始过程,发现m¹Ψ还能够促进翻译起始。也就是说,m¹Ψ一方面在特定序列背景下减慢翻译延伸,另一方面增加翻译起始,二者共同影响合成mRNA的蛋白产出。


m¹Ψ对翻译起始的影响[1]


总体来看,m¹Ψ对蛋白产出的影响涉及核糖体占位、翻译延伸和翻译起始等多个环节,而不是单一的翻译速度变化。


ac⁴C调控翻译延伸与核糖体碰撞




【标      题】N⁴-Acetylcytidine enhances synthetic mRNA translation yield and fidelity

【发表期刊】Nature

【发表日期】2026年7月1日

【研究团队】美国国立卫生研究院国家癌症研究所 Shalini Oberdoerffer 团队、约翰·霍普金斯大学 Bin Wu 团队

【主要技术】单分子翻译成像、Polysome profiling、Ribo-seq、核糖体run-off分析

【IF】48.5


研究团队首先比较了不同修饰对合成mRNA翻译的影响。结果显示,在多种细胞和动物体系中,ac⁴C修饰mRNA具有较高的蛋白产量,同时保持较低的炎症反应。


不同核苷修饰对合成mRNA蛋白表达的影响[2]


随后,研究团队利用单分子翻译成像和 Polysome profiling 分析不同修饰mRNA的翻译状态。结果显示,ac⁴C和m¹Ψ修饰mRNA均具有较高的核糖体参与水平;Polysome profiling进一步显示,修饰后的mRNA更多分布于重多聚核糖体组分,其中m¹Ψ的富集更为明显。


尽管m¹Ψ修饰mRNA具有较高的核糖体占位,其蛋白产出仍低于ac⁴C修饰mRNA。研究团队进一步分析翻译延伸过程,发现m¹Ψ修饰mRNA的翻译延伸速度明显低于ac⁴C,延伸时间约为后者的两倍。


m¹Ψ与ac⁴C对翻译延伸速度的影响[2]


较慢的翻译延伸伴随着更多的核糖体停滞和碰撞。进一步结合移码报告系统和Ribo-seq分析发现,m¹Ψ修饰mRNA在富U区域出现更明显的核糖体积累,并伴随更高水平的+1移码;ac⁴C修饰条件下未观察到相同程度的变化。



Ribo-seq揭示m¹Ψ修饰mRNA中的核糖体积累[2]


总体来看,ac⁴C与m¹Ψ均可影响合成mRNA的翻译状态,但两者在翻译延伸速度、核糖体碰撞和翻译保真度方面存在差异。研究结果表明,除核糖体装载外,翻译延伸过程同样会影响mRNA的蛋白产出。


从RNA表达进一步观察翻译过程




两项研究中,Ribo-seq和Polysome profiling从不同维度解析了mRNA的翻译状态。Ribo-seq通过分析核糖体保护片段,可以观察核糖体在转录本上的分布,并进一步开展翻译效率、ORF/uORF及潜在翻译事件分析;Polysome profiling则根据RNA结合核糖体数量的差异,分析不同RNA的核糖体装载状态和整体翻译活性。


对于与核糖体结合的全长RNA,可通过RNC-seq进行分析;当研究关注核糖体停滞和碰撞等翻译异常状态时,Disome-seq可用于解析双核糖体保护片段及相关调控过程。


因此,不同翻译组技术对应不同的研究问题,可根据研究目的选择相应的技术路线。


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吉赛生物

聚焦RNA到蛋白之间的翻译调控

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围绕RNA翻译调控研究,吉赛生物提供包括Ribo-seq、RNC-seq、Polysome profiling / Polysome-seq和Disome-seq在内的翻译组技术服务,可从核糖体占位、RNA翻译状态到核糖体停滞与碰撞等不同层面开展分析,并结合转录组、蛋白组等多组学数据,为翻译调控相关研究提供技术支持。


参考文献




1.Rozman B, Broennimann K, Rajan KS, et al. N¹-Methylpseudouridine directly modulates translation dynamics. Nature. 2026;651:533–541. DOI: 10.1038/s41586-025-09945-5.

2.Schiffers S, Nelson BW, Prigge M, et al. N⁴-Acetylcytidine enhances synthetic mRNA translation yield and fidelity. Nature. 2026;656:1034–1043. DOI: 10.1038/s41586-026-10729-8.